Les chercheurs spécialistes de l’écologie microbienne de l’unité mixte de recherche « Agroécologie », rattachée à l’INRAE Bourgogne Franche-Comté ont inventorié les champignons des sols grâce aux techniques de séquençage génétique. Ils ont ainsi pu étudier la composition, l’organisation et la répartition des réseaux mycéliens dans les différents types de sols, l’influence des conditions écologiques et de l’utilisation des sols par l’homme. Ils nous ouvrent une fenêtre sur un monde méconnu et fascinant.
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Auteurs : DJEMIEL C., TERRAT S., DEQUIEDT S., JOLIVET C., MARON P.-A. & RANJARD L. 2024. Mèze ; Biotope, MNHN, 304 p.Hors coll ; Tome 49). via @INRAE_DipSO @ClaireChenu2 @c_djemiel
Avec 83 individus détectés au minimum en 2023, l'effectif de la population d'Ours brun continue progressivement d'augmenter dans les Pyrénées. C'est l'un des résultats présentés dans le rapport annuel 2023 du suivi de l'espèce dans les Pyrénées françaises, réalisé par le réseau Ours brun.
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Date d'édition : avril 2024, 59 pages. Éditeur : Office français de la biodiversité. En savoir plus sur le Réseau Ours brun
Le concours du Mollusque international de l'année s'ouvre mercredi. Il vise à mettre en lumière ces espèces pour mieux les protéger. Comme chaque année, le génome du mollusque qui remportera le concours sera cartographié pour mieux comprendre son évolution et son intérêt scientifique.
L’ADN environnemental est une sorte d’empreinte que l’on laisse derrière soi, dans le sol, l’eau ou encore l’air et qui permet de suivre l’état de la biodiversité. Une nouvelle étude dévoile une méthode innovante pour capter ces ADNe : les piéger dans les toiles d’araignées.
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Avec sciences France culture, @AlexandraDelbot avec
La Liste Rouge des espèces menacées requiert des données suffisamment précises sur les espèces à évaluer afin d’obtenir un résultat robuste. C’est dans cette optique que le Pôle-relais zones humides tropicales s’est associé à Sentinelle Lab, spécialiste des espèces d’eau douce de Guadeloupe, afin de poursuivre les efforts d’acquisition de connaissances sur les poissons et crustacés du territoire.
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Rapport final de l’étude (sept 2023) et Atlas cartographique de la répartition de l’ichtyofaune et de la carcinofaune dulçaquicoles de la Guadeloupe (2005 à 2022) disponibles sur cette page
Comprendre : Estimer l’effort d’échantillonnage de réseaux participatifs : l’exemple du réseau Loup-lynx
Changer : Entretien avec François Sarano, docteur en océanographie.
Dossier : Atténuer les pressions sur les mammifères marins
Agir : Une méthode pour évaluer le potentiel de gain écologique d'un site
Se repérer : La biodiversité française en déclin
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A savoir : 6 mois après sa publication, un numéro de la revue Biodiversité, des clés pour agir est consultable gratuitement. Feuilletez le n°3 et son dossier " Aider les rivières à reprendre leur cours " https://professionnels.ofb.fr/doc/biodiversi
Des appareils de surveillance de la pollution atmosphérique remplissent une seconde fonction, jusqu’ici inconnue, mais cruciale dans les efforts pour sauver la biodiversité mondiale, indique une nouvelle étude : la récupération de fragments d’ADN.
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Article de recherche : Air-quality networks collect environmental DNA with the potential to measure biodiversity at continental scales. Joanne E. Littlefair & al. Current Biology, Volume 33, ISSUE 11, PR426-R428, June 05, 2023 https://doi.org/10.1016/j.cub.2023.04.036
There is an urgent need to evaluate the effects of anthropogenic pressures and climatic change on fish populations’ dynamics. When monitored in lakes, fish spawning is generally assessed using traditional, mostly destructive or damaging, methods as gillnetting and collection of fertilized eggs. Over the last decade, environmental DNA (eDNA) based methods have been widely developed and now offer a non-invasive alternative method to these traditional biomonitoring tools.
La malacologie est l’étude des mollusques. Considérée comme difficile voire inaccessible même par des naturalistes confirmés, cette discipline est un des domaines d’expertise de la direction régionale Grand Est de l’Office français de la biodiversité, notamment sur les grands bivalves appelés naïades.
Par Virginie Courtier-Orgogozo, directrice de recherche au CNRS, professeure associée à l'École polytechnique, professeure invitée du Collège de France.
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Replay de la séance du 9/02/2023. Suivez @Biol4Ever
De nombreux intervenants des organismes suivants : l’AFL, CdR EEE, ENGEES Universités, OFB, Ministère développement durable 3:26:35 Alain Dutartre, Centre de Ressources EEE, IIBSN, Voies Navigables de France, PNR Brière, Centre de Ressources EEE.
La France, qui possède le deuxième domaine maritime mondial, va séquencer le génome de milliers d'espèces peuplant ses eaux métropolitaines et d'outre-mer, afin d'élaborer une "cartographie génétique" de sa biodiversité marine, outil-clé pour mieux la préserver.
L’ADN environnemental (ADNe) est une technique de surveillance de la biodiversité non invasive pour les milieux naturels et les espèces. Cette approche basée sur la récolte de d'échantillons du milieu (eau, sol, fèces...) permet d’identifier les différents êtres vivants qui résident ou ont traversé ce milieu naturel, y compris des espèces rares.
Dans un contexte agricole et alimentaire tendu, la transition du système alimentaire vers des processus et pratiques plus soutenables est souvent remise en question. Une série de découvertes en écologie et en agriculture suggère que la biodiversité, tant spécifique que génétique, peut aider à résoudre les problèmes de durabilité auxquels est confrontée l’agriculture intensive moderne. […]
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Référence de l’article : Renard, D., & Tilman, D. (2021). Cultivate biodiversity to harvest food security and sustainability. Current Biology, 31(19), R1154-R1158. https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.06.082
Synthèse par : Hélène Soubelet, directrice de la Fondation pour la recherche sur la biodiversité (FRB)
Parmi les techniques de suivi de la biodiversité, on retrouve une technique de pointe : celle de l’analyse de l’ADN environnemental. Quelles sont les informations que peut nous apporter ce matériel génétique relâché par les organismes dans leur environnement ?
Le plus grand évènement de dispersion d’un loup mâle (GW1909m) documenté en Europe grâce au réseau international de suivi de l’espèce et à la collaboration scientifique autour des analyses génétiques en Europe de l’Ouest. Les populations de loup s’étendent actuellement en Europe notamment en raison d’une protection juridique stricte depuis la fin des années 70.
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Page consacrée au réseau Loup-lynx, piloté par l’Office français de la biodiversité qui se compose de près de 4500 correspondants présents sur l’ensemble des départements français
Face aux changements globaux actuels, l’enjeu des suivis de la dynamique de la biodiversité est croissant et entraîne une forte demande d’évaluations rapides et détaillées des changements de biodiversité. L’identification moléculaire des espèces est de plus en plus utilisée pour remplacer ou compléter les méthodes de surveillance écologique plus classiques. Le metabarcoding est considéré comme un outil d’inventaire, de connaissance de la biologie (prédateurs proies, pollinisateurs, etc.) et même de la découverte de l’histoire d’écosystèmes. Il permet de générer des données sur la biodiversité de manière rapide, précise et fiable, sur un large éventail d’organismes.
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LE BORGNE H. & BOUGET C. 2024. — La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre. Naturae 2024 (3): 31-67. https://doi.org/10.5852/naturae2024a3
Pour accélérer l’adaptation des forêts de production au réchauffement climatique en cours et futur, l’Homme peut planter à plus hautes latitudes de jeunes semis d’espèces d’arbres et d’arbustes en provenance de régions plus chaudes et plus sèches. Un consortium d’experts en écologie forestière vient de publier un article dans la revue Oikos qui alerte sur les conséquences de ce type de « migration assistée » des espèces pouvant entraîner un emballement climatique.
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Auteurs : Michalet, R., Carcaillet, C., Delerue, F., Domec, J-C. & Lenoir, J. Oikos, publié le 19/12/23. Laboratoire CNRS impliqué Écologie et dynamique des systèmes anthropisés (EDYSAN - Univ. Picardie Jules Verne/CNRS)
La Méditerranée est en surchauffe et ce n'est pas sans effet sur la biodiversité. Lorsque l'eau est plus chaude, les poissons montrent des signes de faiblesse.
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2 minutes avec les chercheurs sur la plage de Frontignan, dans l'Hérault, de Célia Quilleret.
Sous l’impulsion conjointe de l’Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, de l’Université de Montpellier et d’un laboratoire commun financé par l’ANR entre l’Unité de Recherche MARBEC et l’entreprise SpyGen, la Mission BioDivMed 2023 va réaliser un inventaire du vivant synchronisé et standardisé sur le littoral méditerranéen français et le sanctuaire Pelagos par l’utilisation de l’ADN environnemental (ADNe).
Le monde vivant est fascinant. Sa complexité dépasse celle des machines les plus sophistiquées inventées par les humains et celle des objets matériels physiques. Devant les grands défis du XXIe siècle, il est nécessaire d’essayer de comprendre au mieux ce monde vivant...
Un accord crucial, qui régira la création d'aires marines protégées ou le partage des ressources génétiques marines.
C'est la première fois que le grand large, plus précisément les zones situées au-delà de 200 milles nautiques (370 kilomètres) des côtes, sera réglementé. A l'extérieur des zones économiques exclusives (ZEE), la haute mer, qui représente 60 % des océans, n'était jusque-là soumise à aucune juridiction.
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Article qui donne la place aux explications des ONG et des spécialistes du droit de l'environnement.
La Blennie fluviatile (Ichthyocoris fluviatilis) est une espèce protégée, traditionnellement présente sur les cours d’eau méditerranéens ainsi que dans le Rhône.
Alors qu’en 2015, ce poisson d’eau douce était encore absent des cours d’eau de Bourgogne-Franche-Comté, il a été repéré pour la première fois par des pêcheurs en 2018 dans la Saône. Depuis, sa présence a été confirmée par des pêches électriques réalisées par le bureau d’études AQUABIO pour le compte de l’Office français de la biodiversité et des traces d’ADN de l’espèce ont également été retrouvées jusqu’en Côte d’Or.
Un félin rare et discret a élu domicile sur le Toit du monde. Des chercheurs ont en effet découvert les traces de chats de Pallas (Otocolobus manul) sur l'Everest.
La Guyane présente un réseau hydrographique dense avec sept bassins versants majeurs qui abritent plus de 400 espèces de poissons, et représente près de 76 % de la faune piscicole d’eau douce française. Ce territoire qui occupe 1 % de la surface de la région amazonienne est également le mieux préservé et couvert à plus de 90 % de forêt équatoriale. La Guyane est soumise à une forte croissante démographique (2.5 % / an) qui s’accompagne d’une hausse des activités humaines.
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Auteurs : DJEMIEL C., TERRAT S., DEQUIEDT S., JOLIVET C., MARON P.-A. & RANJARD L. 2024. Mèze ; Biotope, MNHN, 304 p.Hors coll ; Tome 49). via @INRAE_DipSO @ClaireChenu2 @c_djemiel