Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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ITOFF, une nouvelle base de données mondiale de traits d’histoire de vie des poissons d’eau douce pour évaluer les relations entre espèces indigènes et espèces exotiques envahissantes

ITOFF, une nouvelle base de données mondiale de traits d’histoire de vie des poissons d’eau douce pour évaluer les relations entre espèces indigènes et espèces exotiques envahissantes | Biodiversité | Scoop.it

Depuis plusieurs décennies, la détermination des facteurs responsables du succès des invasions biologiques a été largement étudiée par la communauté scientifique à l’échelle mondiale (e.g., Pyšek et al.,2020 ; Bernery et al., 2023). Parmi ces facteurs, les traits d’histoire de vie (i.e., une caractéristique du cycle de vie d’une espèce qui a une incidence sur sa survie et sa reproduction) des espèces sont reconnus comme un facteur important de succès : par exemple, dans certaines conditions, une espèce caractérisée par son régime alimentaire carnivore aura plus de chance d’envahir avec succès un nouvel écosystème qu’une espèce végétarienne. Explorer et déterminer quels sont ces traits d’histoire de vie et en quoi ils sont différents de ceux des espèces qui ne sont pas envahissantes est une démarche importante pour tenter de prévenir de nouvelles invasions (Pyšek et al.,2020).

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La base de données : https://itoff-dataset.wp.st-andrews.ac.uk/database/

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Recenser les oiseaux, identifier les plantes : les sciences participatives font-elles vraiment avancer la recherche ?

Recenser les oiseaux, identifier les plantes : les sciences participatives font-elles vraiment avancer la recherche ? | Biodiversité | Scoop.it
Les sciences participatives invitent tout un chacun à apporter sa pierre à l'édifice de la recherche. Mais comment déterminer l'apport réel de cette pratique aux connaissances ?
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Auteurs : Bastien Castagneyrol Chercheur en écologie, Inrae et Baptiste Bedessem Chargé de recherche, Inrae

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On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys

On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys | Biodiversité | Scoop.it

Abstract: Designing a large-scale multispecies survey presents significant challenges due to its multivariate, multiscale, and often multiobjective nature. Because it is impractical to measure or observe all variables of interest at every location in the survey area, spatial sampling is crucial. To ensure a statistically sound survey, free of assumptions, randomization of the selection of spatial sampling units is required. In a large-scale survey, minimizing travel costs requires multistage sampling in which nearby sampling units are grouped within higher-level sampling units.

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Philippe Aubry, Gwenaël Quaintenne, Jeremy Dupuy, Charlotte Francesiaz, Matthieu Guillemain, Alain Caizergues, Ecological Informatics,Volume 77,2023, https://doi.org/10.101/j.ecoinf.2023.102229 via @C_Francesiaz

Article en lien avec l’enquête Limat qui a pour but d’estimer les effectifs nicheurs des différentes espèces d’anatidés et de limicoles sur le territoire métropolitain https://professionnels.ofb.fr/fr/node/1336 via @GSouchay

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Biodiversité : à Rouen, les bus écoutent les oiseaux, insectes et chauves-souris - Le Parisien

Biodiversité : à Rouen, les bus écoutent les oiseaux, insectes et chauves-souris - Le Parisien | Biodiversité | Scoop.it
En partenariat avec le Muséum d’Histoire naturelle de Paris, la startup Birdz compte les insectes, les oiseaux et les chauves-souris de la Métropole Rouen Normandie pour faire un constat de l’état de la biodiversité.
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Site web @MetropoleRouenN https://www.metropole-rouen-normandie.fr/actualite/2023/les-chauve-souris-pointent-la-ligne-45486 La start up @birdz_iot s’est associé au Muséum national d’Histoire naturelle en utilisant la technologie pour écouter et préserver la nature.
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Enquête sur le futur système d’information espèces exotiques envahissantes jusqu'au 6 mars 2023

Enquête sur le futur système d’information espèces exotiques envahissantes jusqu'au 6 mars 2023 | Biodiversité | Scoop.it

Le développement du SI-EEE a pour vocation de faciliter le rapportage demandé dans le cadre règlement européen n°1143/2014 sur les EEE (article 24) et définit par le règlement d’exécution européen (2017/1454). Il répond à la mise en œuvre de l’arrêté ministériel du 31 décembre 2020  concernant le Schéma National des Données sur la Biodiversité  en facilitant notamment la prise en compte par les politiques publiques et les citoyens des pressions exercées par les EEE sur la biodiversité, ainsi que des actions susceptibles d’enrayer ce déclin.


Via Pipistrella
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Télécharger et remplir (environ 30 min) le formulaire disponible au lien suivant

Nombreuses infos à consulter sur le Centre de ressources espèces exotiques envahissantes

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Biodiversité : Une « cascade » d'extinctions menace les animaux et les plantes

Biodiversité : Une « cascade » d'extinctions menace les animaux et les plantes | Biodiversité | Scoop.it

Entre 6 et 10 % des animaux et des plantes pourraient disparaître d'ici à 2050, selon une étude. Cette estimation s’appuie sur de nouveaux outils de modélisation forgés par deux scientifiques européen et australien, afin de mieux prendre en compte les « co-extinctions », fruits de la disparition « en cascade » d’espèces interdépendantes.

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Suivre Corey Bradshaw, l'un des auteurs sur Twitter @conservbytes

 
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More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction - Communications Biology

More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction - Communications Biology | Biodiversité | Scoop.it

The IUCN Red List of Threatened Species is essential for practical and theoretical efforts to protect biodiversity. However, species classified as “Data Deficient” (DD) regularly mislead practitioners due to their uncertain extinction risk. Here we present machine learning-derived probabilities of being threatened by extinction for 7699 DD species, comprising 17% of the entire IUCN spatial datasets. Our predictions suggest that DD species as a group may in fact be more threatened than data-sufficient species. We found that 85% of DD amphibians are likely to be threatened by extinction, as well as more than half of DD species in many other taxonomic groups, such as mammals and reptiles.

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Borgelt, J., Dorber, M., Høiberg, M.A. et al. More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction. Commun Biol 5, 679 (2022). https://doi.org/10.1038/s42003-022-03638-9

via @Shoal_Org @david_tickner @CommsBio

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A review of the heterogeneous landscape of biodiversity databases: Opportunities and challenges for a synthesized biodiversity knowledge base

A review of the heterogeneous landscape of biodiversity databases: Opportunities and challenges for a synthesized biodiversity knowledge base | Biodiversité | Scoop.it

Addressing global environmental challenges requires access to biodiversity data across wide spatial, temporal and taxonomic scales. Availability of such data has increased exponentially recently with the proliferation of biodiversity databases. However, heterogeneous coverage, protocols, and standards have hampered integration among these databases.

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via @GEB_macro

voir Webb Thomas J.and Vanhoorne Bart 2020 Linking dimensions of data on global marine animal diversityPhil. Trans. R. Soc. B3752019044520190445http://doi.org/10.1098/rstb.2019.0445

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Lutter contre la cybercriminalité - Saison 2, épisode 6

Lutter contre la cybercriminalité - Saison 2, épisode 6 | Biodiversité | Scoop.it
Découvrez comment nous nous mobilisons aux côtés de TRAFFIC, Interpol, l’IFAW et les douanes belges, pour mettre fin au commerce illégal d'espèces sauvages dans l’Union Européenne
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Emilie Van der Henst du WWF Belgique, Lorélie Escot du WWF France et Jérôme Legrand, inspecteur de l'environnement à l'OFB vous racontent les dessous de ce projet, les victoires comme les difficultés auxquels ils font face pour démanteler ces trafics.

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Tracking species invasions with digital biodiversity data

Tracking species invasions with digital biodiversity data | Biodiversité | Scoop.it
Large online data sources are increasingly important to understand biological invasions. Emerging fields of conservation culturomics and iEcology have a great potential to inform invasion science and practice through novel insights and knowledge. In a recent publication, an international research team led by the Biology Centre of the Czech Academy of Sciences is looking at the state of the art of invasion culturomics and iEcology, and their potential applications for research and management of invasive alien species.
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Ivan Jarić et al. Invasion Culturomics and iEcology, Conservation Biology (2021). DOI: 10.1111/cobi.13707

Journal information: Conservation Biology
Suivez @IvanJaric
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Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue

Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue | Biodiversité | Scoop.it

Face à l’inefficacité des zonages classiques de protection pour enrayer la perte de biodiversité, la mise en connexion des habitats naturels pour permettre aux espèces animales et végétales de se déplacer est devenue un enjeu majeur des politiques environnementales. L’identification et la gestion des réseaux écologiques soulève néanmoins des difficultés face à la diversité des méthodes pour analyser la connectivité et le manque de données harmonisées à l’échelle d’un pays. L’objectif de cette étude est d’utiliser la théorie des graphes pour intégrer plus finement la connectivité fonctionnelle du paysage dans la modélisation des réseaux écologiques à différentes échelles spatiales.

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Céline Clauzel et Charlotte Bonnevalle, « Apports de la modélisation spatiale pour la gestion de la trame verte et bleue », Cybergeo : European Journal of Geography [En ligne], Environnement, Nature, Paysage, document 900, mis en ligne le 05 juin 2019, consulté le 05 août 2019. URL : http://journals.openedition.org/cybergeo/32333 ; DOI : 10.4000/cybergeo.32333

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Cinq applications pour découvrir la biodiversité

Cinq applications pour découvrir la biodiversité | Biodiversité | Scoop.it
Plantes, fleurs, oiseaux, insectes... Plusieurs applications sur Smartphone permettent d'en savoir plus sur les espèces que l'on peut croiser. Zoom sur cinq d'entre elles.
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CAMPanule - CAtalogue de Méthodes et Protocoles d’acquisition de données naturalistes

CAMPanule - CAtalogue de Méthodes et Protocoles d’acquisition de données naturalistes | Biodiversité | Scoop.it

Les données naturalistes, essentielles au développement des connaissances sur la biodiversité, sont produites par de nombreux acteurs et selon des modalités hétérogènes. Issues de contacts opportunistes, de suivi ou d’inventaires nationaux, produites par des experts, des gestionnaires, des chercheurs, elles répondent à des objectifs variés et présentent des limites d’utilisation qu’il convient de prendre en compte.

Connaître le plus précisément possible les modalités d’acquisition des données naturalistes s’avère indispensable pour mieux gérer et exploiter les informations.

 

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"Le projet a pour objectif de constituer un catalogue qui rassemble et caractérise les techniques, méthodes et protocoles d’acquisition de données naturalistes en France."

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L'imageomique, un nouveau domaine scientifique qui fait appel à l'IA pour comprendre le monde vivant

L'imageomique, un nouveau domaine scientifique qui fait appel à l'IA pour comprendre le monde vivant | Biodiversité | Scoop.it

Analyser des centaines de milliers d'images d'animaux, de plantes ou de microorganismes : c'est désormais possible en un temps record grâce aux nouveaux outils...


Via Hubert MESSMER
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How AI can help to save endangered species

How AI can help to save endangered species | Biodiversité | Scoop.it
Scientists are using artificial intelligence to fight biodiversity loss by analysing vast amounts of data, monitoring ecosystems and spotting trends over time.
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Auteur Tosin Thompson Nature 623, 232-233 (2023)

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-023-03328-4

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Nouvelle version de l’application « INPN Espèces » pour sensibiliser les scolaires à la biodiversité française

Nouvelle version de l’application « INPN Espèces » pour sensibiliser les scolaires à la biodiversité française | Biodiversité | Scoop.it
Depuis son lancement en 2016, INPN Espèces est un projet participatif qui permet à partir d’une application mobile gratuite de découvrir l'ensemble de la biodiversité et de contribuer à l’inventaire du patrimoine naturel en métropole et en outre-mer (INPN). Portée par le centre d’expertise PatriNat (Muséum national d’Histoire naturelle, Office français de la biodiversité, Centre National de Recherche Scientifique, Institut de recherche pour le développement), l’application propose aujourd’hui une nouvelle version, plus ergonomique et encore plus facile d’accès. Cette actualisation ajoute de nouvelles fonctionnalités dédiées spécifiquement aux enseignants et à leurs classes, de la maternelle au lycée. L’objectif ? Sensibiliser et accompagner les jeunes générations afin qu’elles découvrent la richesse de la biodiversité et l’étude de la nature.
DocBiodiv's insight:

Tout savoir sur INPN espèces https://inpn.mnhn.fr/accueil/participer/inpn-especes

Programmes de sciences participatives https://www.vigienature.fr/fr

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Lettre d'information INPN Espèces n°19 Avril 2023

Lettre d'information INPN Espèces n°19 Avril 2023 | Biodiversité | Scoop.it

Le bilan INPN Espèces 2022 est sorti ! Vous pouvez y retrouver de nombreux chiffres-clés et synthèses de l'année.
Nous vous présentons également dans cette lettre le témoignage d'une utilisatrice, de quoi nous inciter davantage à vous proposer des outils qui vous satisfasse !
En parlant d'outils, deux nouveaux livrets pédagogiques sur les Oiseaux et les Mollusques sont diffusés et disponibles en ligne !
De nouvelles quêtes nationales et locales sont également diffusées pour ce printemps.

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[Replay - webinaire] Explorer les dynamiques agricoles d'un territoire grâce au logiciel RPG Explorer

[Replay - webinaire] Explorer les dynamiques agricoles d'un territoire grâce au logiciel RPG Explorer | Biodiversité | Scoop.it
Le logiciel RPG Explorer contribue à l'évaluation des risques de pollution des eaux par les nitrates ou les produits phytosanitaires. Son utilisation est particulièrement intéressante dans les aires d'alimentation de captages où la connaissance des systèmes de culture est précieuse. Au programme du webinaire : principes d'utilisation et exemples d'application de cet outil par les concepteurs.
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Voir aussi le Centre de ressources Captages 

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Des chercheurs produisent une carte mondiale de la biodiversité végétale

Des chercheurs produisent une carte mondiale de la biodiversité végétale | Biodiversité | Scoop.it

Comment les espèces de plantes sont-elles réparties sur notre planète ? Il est désormais possible de le visualiser, grâce à la création d'une "carte mondiale de la diversité végétale" par une équipe internationale, dirigée par des chercheurs de l'Université de Göttingen (Allemagne). Dans un communiqué publié le 15 novembre 2022, ils présentent en effet leurs prédictions sur l'emplacement et le nombre de spécimens à travers le globe. Une initiative qui devrait "[soutenir] les efforts de conservation, [aider] à protéger la diversité végétale et [évaluer] les changements à la lumière des crises actuelles de la biodiversité et du climat", écrivent-ils.


Via Hubert MESSMER
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Cai, L., Kreft, H., Taylor, A., Denelle, P., Schrader, J., Essl, F., van Kleunen, M., Pergl, J., Pyšek, P., Stein & al. (2022), Global models and predictions of plant diversity based on advanced machine learning techniques. New Phytol. https://doi.org/10.1111/nph.18533

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Insectes, plantes, fleurs, oiseaux : découvrez les meilleures applications pour les identifier

Insectes, plantes, fleurs, oiseaux : découvrez les meilleures applications pour les identifier | Biodiversité | Scoop.it
Votre curiosité pour la Nature n'a pas de limites ? Identifiez toutes les espèces animales et végétales que vous croisez grâce à ces applis.
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Mathilde SalléDeChou le  27/04/2022 sur @ThePOSITIVR
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Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement

Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement | Biodiversité | Scoop.it

So-called “big-data” approaches have revolutionized fields of research from astronomy to genetics. Such approaches are not limited to fields that seem inherently technical, because the combination of rapid data collection and advanced analytical techniques could be applied to almost any scientific question. Nathan et al. reviewed how these modern approaches are being applied to the very old field of animal tracking and monitoring. Large-scale data collection can reveal details about how animals use their environment and interact with each other that were impossible to explore previously.

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Science • 18 Feb 2022 • Vol 375, Issue 6582DOI: 10.1126/science.abg1780
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Qui est cette girafe ? Quand l'intelligence artificielle automatise la reconnaissance individuelle des animaux

Qui est cette girafe ? Quand l'intelligence artificielle automatise la reconnaissance individuelle des animaux | Biodiversité | Scoop.it

De nombreux suivis à long terme en écologie reposent sur notre capacité à reconnaître les animaux individuellement, souvent d'une année sur l'autre. Afin d’étudier la démographie des populations de girafes, les écologues procèdent à des "captures" photographiques au sein de la zone Atelier de Hwange du CNRS au Zimbabwe. Chaque girafe a un pelage composé d'une myriade de taches distinctes qui permet à un œil entraîné de la reconnaître... c'est ce que l'ordinateur sait désormais faire !

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Miele, V., Dussert, G., Spataro, B., Chamaillé-Jammes, S., Allainé, D., & Bonenfant, C. (2021). Revisiting giraffe photo-identification using deep learning and network analysis. Methods in Ecology and Evolution. DOI 10.1111/2041-210X.13577

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L’intelligence artificielle différencie les oiseaux d’une même espèce

L’intelligence artificielle différencie les oiseaux d’une même espèce | Biodiversité | Scoop.it

Reconnaitre individuellement les oiseaux grâce au motif de leur plumage, voilà une tâche ardue pour l’humain. Mais pas pour la machine ! Une collaboration internationale impliquant principalement des scientifiques du CNRS, de l’Université de Montpellier1et de l’Université de Porto au Portugal, vient de montrer comment des ordinateurs peuvent apprendre à différencier les individus d’une même espèce d’oiseaux. Ces résultats sont publiés le 27 juillet 2020 dans Methods in Ecology and Evolution.

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Deep learning-based methods for individual recognition in small birds, André C. Ferreira, Liliana R. Silva, Francesco Renna, Hanja B. Brandl, Julien P. Renoult, Damien R. Farinec, Rita Covas et Claire Doutrelant, Methods in Ecology and Evolution le 27 juillet 2020. DOI: 10.1111/2041-210X.13436

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L’IA de Google écoute le chant des baleines pour les protéger

L’IA de Google écoute le chant des baleines pour les protéger | Biodiversité | Scoop.it

Google et un groupe de cétologues ont entrepris d'exploiter plusieurs années d'enregistrements sous-marins. Leur objectif : créer un modèle d'apprentissage automatique capable de détecter les chants de baleines à bosse. Ceci va permettre de mieux suivre les déplacements des cétacés et de les protéger, notamment contre les risques de collision avec les navires.


Via Hubert MESSMER
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Une collaboration avec la National Oceanic and Atmospheric Administration

DocBiodiv's curator insight, October 31, 2018 6:47 AM

Une collaboration avec la National Oceanic and Atmospheric Administration

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Un cadre détaillé pour comprendre l’histoire évolutive des oiseaux forestiers de l’hémisphère nord - Jacques BLONDEL - Naturae 2018 (3) - Pages 27-42

Un cadre détaillé pour comprendre l’histoire évolutive des oiseaux forestiers de l’hémisphère nord - Jacques BLONDEL  - Naturae 2018 (3) - Pages 27-42 | Biodiversité | Scoop.it

Les avancées méthodologiques spectaculaires réalisées au cours des deux dernières décennies dans des domaines aussi variés que la biogéographie, la paléoécologie, la phylogénétique et la bio­informatique permettent de retracer sur de nouvelles bases l’histoire évolutive des oiseaux. En particulier, les méthodes modernes d’acquisition de données moléculaire de taxons éteints et actuels ont révolutionné la construction de l’histoire phylogénétique des lignées. Ces avancées éclairent d’un jour nouveau le tempo et le mode ainsi que le contexte spatial et temporel des processus de différenciation qui façonnèrent la composition et la structure des communautés d’oiseaux forestiers des principaux blocs forestiers de l’hémisphère nord (nord-est de l’Amérique du Nord, Europe, Asie de l’Est).

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