Biodiversité

Sous l’impulsion conjointe de l’Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, de l’Université de Montpellier et d’un laboratoire commun financé par l’ANR entre l’Unité de Recherche MARBEC et l’entreprise SpyGen, la Mission BioDivMed 2023 va réaliser un inventaire du vivant synchronisé et standardisé sur le littoral méditerranéen français et le sanctuaire Pelagos par l’utilisation de l’ADN environnemental (ADNe).

A la veille de cette conclusion tant espérée, plusieurs contentieux étaient toujours sur la table : procédure de création des aires marines protégées, modalité de mise en œuvre des études d’impact sur l’environnement des activités envisagées en haute mer, ou encore partage des potentiels bénéfices issus des ressources marines génétiques.

La France, qui possède le deuxième domaine maritime mondial, va séquencer le génome de milliers d'espèces peuplant ses eaux métropolitaines et d'outre-mer, afin d'élaborer une "cartographie génétique" de sa biodiversité marine, outil-clé pour mieux la préserver.

The impact of climate change on diversity, functioning and biogeography of marine plankton remains a major unresolved issue. Here environmental niches are evidenced for plankton communities at the genomic scale for six size fractions from viruses to meso-zooplankton. The spatial extrapolation of these niches portrays ocean partitionings south of 60° N into climato-genomic provinces characterized by signature genomes.

Une équipe de chercheurs internationaux (Norvège, Suisse, France, UK, Allemagne, Espagne, USA) a produit et analysé un jeu de données de metabarcoding ADN à partir de 1700 échantillons prélevés dans les couches photique, aphotique, et sédimentaires profondes de l'océan à l'échelle planétaire. Les résultats, publiés dans Science Advances, montrent que les abysses abritent une biodiversité largement supérieure à celle du plancton, et en majorité inconnue.

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Les agents du Parc naturel marin d'Iroise réalisent des prélèvements et analyses d'eau pour:
- Vérifier la qualité bactériologique (eaux de baignade)
-Étudier les évolutions dans la qualité et la quantité de plancton, en lien avec les phénomènes océanographiques
- Vérifier la qualité chimique (nitrates, phosphates...)
Ces prélèvements permettent de cibler les actions et de mieux comprendre les phénomènes. Par exemple, les analyses bactériologiques couplées à une analyse ADN permettent de remonter à la source des pollutions sur les cours d'eau et donc de les stopper, généralement en lien avec les collectivités territoriales.

La biodiversité marine appartient à l’humanité entière, pense-t-on spontanément. Or, des chercheurs des universités de Stockholm, en Suède, et de la Colombie-Britannique ont découvert que près de 13 000 séquences génétiques issues de centaines d’espèces marines ont été brevetées par des entreprises provenant de 10 pays seulement, dont l’Allemagne (49 % des brevets), les États-Unis (13 %) et le Japon (12 %).

Il est impossible de localiser chaque requin dans la mer. Mais nous pouvons détecter leur « ADN environnemental ».

La Méditerranée est en surchauffe et ce n'est pas sans effet sur la biodiversité. Lorsque l'eau est plus chaude, les poissons montrent des signes de faiblesse.

Un accord crucial, qui régira la création d'aires marines protégées ou le partage des ressources génétiques marines.

C'est la première fois que le grand large, plus précisément les zones situées au-delà de 200 milles nautiques (370 kilomètres) des côtes, sera réglementé. A l'extérieur des zones économiques exclusives (ZEE), la haute mer, qui représente 60 % des océans, n'était jusque-là soumise à aucune juridiction.

Les gouvernements sont réunis à partir de ce lundi, à New York, pour finaliser un traité international destiné à préserver la biodiversité dans des zones jusqu'ici très peu régulées. La question financière sera au coeur des débats.

Les Expéditions d'ADN environnemental est une initiative scientifique citoyenne mondiale qui permettra de mesurer la biodiversité marine et les effets que le changement climatique...

L’ADN environnemental révèle que la biodiversité des grands fonds est bien plus importante que ce que l’on pensait, avec plus d’un tiers des espèces encore inconnues.

Ships moving species across the oceans mix marine communities throughout latitudes. The introduction of new species may be changing the ecosystems even in remote islands. In tropical Pacific islands where maritime traffic is principally local, eDNA metabarcoding and barcoding revealed 75 introduced species, accounting in average for 28% of the community with a minimum of 13% in the very remote Rangiroa atoll. The majority of non-native species were primary producers –from diatoms to red algae, thus the ecosystem is being transformed from the bottom.

Both scientists and managers hope that the rigorous development of these analyses will allow us to address important science and management questions through our ability to census marine biota across multiple trophic levels with a single sample of DNA. Species of special interest for eDNA observation include those that are commercially important, protected, or invasive. The techniques are also amenable to automation in situ and deployment in global observing systems. At this time there are significant challenges to making rapid and major advances in understanding the techniques and their application to decision-making and management related to both analytical methods and strategies for sampling. The UN Decade of Ocean Science for Sustainable Development offers the potential to engage scientists and managers around the world to resolve these challenges and develop an observational strategy that can answer critical questions for each.

Les poissons clowns n’ont pas la capacité génétique de s’adapter aux modifications de leur environnement. C’est ce que viennent de démontrer des scientifiques du CNRS1 et leurs collègues australiens, saoudiens, chiliens et américains dans une étude, sans précédent pour le milieu sous-marin, à paraitre le 26 novembre 2019 dans Ecology Letters.

L'intérêt pour ces ressources, longtemps négligées faute d'être connues et de la technologie nécessaire pour les exploiter, s'est amplifié à partir des années 1980. Au cours des quinze dernières années, le nombre de dépôts de brevets internationaux liés à des espèces marines s'est envolé, selon une étude parue en juin dans la revue Science Advances.

Et la tendance va se poursuivre, avec un marché mondial des biotechnologies marines qui pourrait peser 6,4 milliards de dollars d'ici 2025.

L'étude des génomes, notamment humain, bénéficie aujourd'hui de l'apport du big data et des outils qui lui sont associés. Quelques exemples et problématiques.