Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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Catalogue Inventaire des Données de Recherche en Environnement et Sociétés

Catalogue Inventaire des Données de Recherche en Environnement et Sociétés | Biodiversité | Scoop.it

La dernière version du catalogue cat.InDoRES a permis la mutualisation des référentiels utilisés par les Zones Ateliers et les Observatoires Hommes-Milieux et offre surtout un catalogue unique, avec des entrées spécifiques à chacun des réseaux. Elle regroupe aujourd’hui plus de 2 500 fiches de métadonnées, faisant gagner en visibilité les projets portés dans le domaine de l’écologie.

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Entretien avec Cécile Callou, directrice de l’unité d’appui et de recherche « Bases de données sur la biodiversité, l’écologie, l’environnement et sociétés » (BBEES – CNRS/MNHN) et Amandine Hénon

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Geotrek, une reconnaissance européenne - Parc national des Ecrins

Geotrek, une reconnaissance européenne - Parc national des Ecrins | Biodiversité | Scoop.it

Geotrek, l'application Open Source de gestion et de valorisation de l'offre de randonnée mise au point par un consortium de partenaires publics français, sous la houlette du Parc national des Écrins, a reçu le grand prix du jury à Bruxelles. Dans la catégorie des meilleures initiatives open source du secteur public européen, parmi 92 participants et 6 finalistes d’un concours organisé par l’observatoire Open Source de la Commission Européenne.

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Le site : https://geotrek.fr

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Les sciences participatives à la rescousse des cours d’eau qui s’assèchent - INRAE

Les sciences participatives à la rescousse des cours d’eau qui s’assèchent - INRAE | Biodiversité | Scoop.it
COMMUNIQUE DE PRESSE - L’application de sciences participatives DRYRivERS montre déjà des premiers résultats ! Déployée à l’échelle internationale en 2022, elle enregistre en 1 an plus de 4000 contributions. Un ensemble de données en open-source, accessibles à tous via un simple site web. Un démarrage encourageant pour la préservation et la gestion de nos rivières, à l’échelle du globe.
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Site Web de DRYvER https://www.dryver.eu/app

via @INRAE_Lyon_Gre et @DRYvER_H2020

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La France devient le 2e pays contributeur du système mondial d’information sur la biodiversité

La France devient le 2e pays contributeur du système mondial d’information sur la biodiversité | Biodiversité | Scoop.it
Actualité INPN - Inventaires d'espèces -

Le GBIF (Global Biodiversity Information Facility, ou Système mondial d'information sur la biodiversité) est un réseau international dont le but est de mettre à disposition le maximum de données primaires sur la biodiversité via le portail www.gbif.org, de façon libre et gratuite.L’INPN (plateforme nationale du Système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP) contribue au GBIF depuis plusieurs années, en partageant au niveau international les données d’occurrences d’espèces rassemblées par les producteurs de données français sur le territoire national, métropole et outre-mer inclus.

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Voir aussi OpenObs

Consulter @GBIF @gbiffrance et http://www.gbif.fr/

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Habitat Protection Indexes - new monitoring measures for the conservation of coastal and marine habitats - Scientific Data

Habitat Protection Indexes - new monitoring measures for the conservation of coastal and marine habitats - Scientific Data | Biodiversité | Scoop.it

A worldwide call to implement habitat protection aims to halt biodiversity loss. We constructed an open-source, standardized, and reproducible workflow that calculates two indexes to monitor the extent of coastal and marine habitats within protected areas and other effective area-based conservation measures. The Local Proportion of Habitats Protected Index (LPHPI) pinpoints the jurisdictions with the greatest opportunity to expand their protected or conserved areas, while the Global Proportion of Habitats Protected Index (GPHPI) showcases which jurisdictions contribute the most area to the protection of these habitats globally. We also evaluated which jurisdictions have the highest opportunity to contribute globally to protecting habitats by meeting a target of 30% coverage. We found that Areas Beyond National Jurisdiction (ABNJ) have the greatest potential to do so.

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Kumagai, J.A., Favoretto, F., Pruckner, S. et al. Habitat Protection Indexes - new monitoring measures for the conservation of coastal and marine habitats. Sci Data 9, 203 (2022). https://doi.org/10.1038/s41597-022-01296-4 via @AidinNiamir

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Science ouverte: 10 millions de données acquises par l’ sur le milieu marin rendues publiques

Science ouverte: 10 millions de données acquises par l’ sur le milieu marin rendues publiques | Biodiversité | Scoop.it
Chaque jour, l’Ifremer et ses partenaires* collectent, analysent, utilisent et partagent des milliers de données sur les milieux marins et leur santé. Ces données sont aujourd’hui disponibles via le système d’information optimisé Surval accessible depuis le site internet data.gouv.fr. L’ouverture de ces données à la société répond aux engagements de l’Ifremer en tant que signataire de la Charte d’ouverture à la société et s’inscrit dans le cadre du deuxième Plan national pour la science ouverte.
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Accès aux données d'environnement marin et littoral https://wwz.ifremer.fr/surval/

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Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science

Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science | Biodiversité | Scoop.it

In the French West Indies, more than 20 species of cetaceans have been observed over the last decades. The recognition of this hot spot of biodiversity of marine mammals observed in the French Exclusive Economic Zone of the West Indies motivated the French government to create in 2010 a marine protected area (MPA) dedicated to the conservation of marine mammals: the Agoa sanctuary. Threats that cetacean populations face are multiple but well-documented. Cetacean conservation can only be achieved if relevant and reliable data are available, starting by occurrence data. 

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Lire toutes les explications de l'in des auteurs :  @MegaFaunMar_DNA "Notre travail sur le recensement des observations de cétacés au large de la Guadeloupe vient d'être publié en libre accès dans Biodiversity Data Journal"

Coché L, Arnaud E, Bouveret L, David R, Foulquier E, Gandilhon N, Jeannesson E, Le Bras Y, Lerigoleur E, Lopez PJ, Madon B, Sananikone J, Sèbe M, Le Berre I, Jung J-L (2021) Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science. Biodiversity Data Journal 9: e69022. https://doi.org/10.3897/BDJ.9.e69022

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Parution d'une nouvelle description topographique du réseau hydrographique de métropole : la BD TOPAGE®

Parution d'une nouvelle description topographique du réseau hydrographique de métropole : la BD TOPAGE® | Biodiversité | Scoop.it

L'eau est un enjeu et la préservation de ses milieux est essentielle. Pour mieux connaître et protéger l'hydrographie terrestre (rivières et écoulements, plans d'eau...) l'IGN et l'OFB se sont associés afin de constituer un référentiel hydrographique de métropole unique, la base de données TOPAGE®, dont la première édition est parue et diffusée sur le site du Service d'administration nationale des données et référentiels sur l'eau sous licence ouverte de réutilisation Etalab.

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La carte du Morbihan - Conservatoire botanique national de Brest

La carte du Morbihan - Conservatoire botanique national de Brest | Biodiversité | Scoop.it

La carte des grands types de végétation du Morbihan est en accès libre depuis décembre 2020. 684 396 hectares ont été cartographiés.

Quelle analyse peut-on faire du territoire ? Le paysage du Morbihan est fortement impacté par l’activité humaine, notamment au nord-est. Les milieux artificialisés (cultures, vergers, cultures, parcs et jardins, bâti, routes) représentent 53% du territoire dont 43% dédiés aux cultures agricoles.

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On en parle déjà dans la presse ! "La Bretagne a désormais sa carte complète de ses grands types de végétation" https://www.francebleu.fr/infos/environnement/la-bretagne-a-desormais-sa-carte-complete-de-ses-grands-types-de-vegetation-1607611088

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Diffusion de la 1ère version de la BD TOPAGE® métropole | Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau

Diffusion de la 1ère version de la BD TOPAGE® métropole | Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau | Biodiversité | Scoop.it

La BD TOPAGE® se compose des jeux de données * des cours d'eau, plans d'eau, tronçons hydrographiques, surfaces élémentaires, noeuds hydrographiques (sources et exutoires), limites terre-mer, bassins hydrographiques et bassins versants topographiques (ces trois derniers jeux de données * seront remplacés par des données plus précises à moyen terme). La première version de la BD TOPAGE® métropole est désormais disponible sur l'atlas-catalogue du Sandre.

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Olivier Gimenez on Twitter: "Avec des collègues de @INRAE_France, @Supagro, #CERPAM et @OFBiodiversite, nous proposons une analyse descriptive du phénomène de concentration d’attaques de loup su...

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 Analyse de la base de données nationale Géoloup en prélude à un article à publier dans une revue scientifique - 3 avril 2020 Olivier Gimenez, Olivier Bonnet, Laurent Garde,Charles-Henri Moulin, Marie-Odile Nozières-Petit, Christophe Duchamp, Michel Meuret.

Le site web pour toutes les infos et actualités

https://www.loupfrance.fr

 

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Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics

Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics | Biodiversité | Scoop.it

Time-lapse cameras facilitate remote and high-resolution monitoring of wild animal and plant communities, but the image data produced require further processing to be useful. Here we publish pipelines to process raw time-lapse imagery, resulting in count data (number of penguins per image) and ‘nearest neighbour distance’ measurements. The latter provide useful summaries of colony spatial structure (which can indicate phenological stage) and can be used to detect movement – metrics which could be valuable for a number of different monitoring scenarios, including image capture during aerial surveys. We present two alternative pathways for producing counts: (1) via the Zooniverse citizen science project Penguin Watch and (2) via a computer vision algorithm (Pengbot), and share a comparison of citizen science-, machine learning-, and expert- derived counts.

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Un papier qui parle données, comptage par piège photographique, projet de science participative concernant des pingouins, technique et matériel, transfert de l'expérience dans d'autres scenarios de suivi et inventaire !

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StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution

StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution | Biodiversité | Scoop.it

Scientists across the globe conduct survey programs to monitor and characterize abundance, population structure, biodiversity and geographical distributions. To assess the state of marine fish and zooplankton, population surveys are often repeated annually using standardized sampling protocols and analysis techniques to establish trustworthy stock status. However, although transparency and repeatability are recognised as important principles of this process, it is often difficult to obtain comprehensive documentation of metadata and data processing steps. This is particularly challenging for workflows that include manual processing steps.

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Connaissez-vous la prospective ? Makina Blog

Connaissez-vous la prospective ? Makina Blog | Biodiversité | Scoop.it

La prospective, également appelée "prospective stratégique" ou "prospective d'entreprise", est une démarche qui vise à anticiper et à analyser les évolutions futures de l'environnement économique, technologique, social, politique et culturel dans lesquelles une entreprise évolue. Elle consiste à explorer les tendances émergentes, les possibles ruptures, les opportunités et les menaces potentielles qui pourraient avoir un impact sur l'entreprise à moyen et long terme.

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Par Cécile Chardonneau, Responsable pôle formation Makina Corpus suite à l'intervention de Pamela Bellier et Emmanuel Turbé sur la définition même de la Prospective et de ses enjeux.

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Ensemble pour une donnée géographique sur l'eau ouverte et interopérable - Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau

Ensemble pour une donnée géographique sur l'eau ouverte et interopérable - Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau | Biodiversité | Scoop.it
Ce document illustre les données géographiques de référence diffusées par le SANDRE par des cartes, des chiffres clés ou encore des applications métiers faites par les partenaires du Système d'Information * sur l'Eau.
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Atlas_referentiels_geographiques_Sandre_2022.pdf

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Indicators of Global Climate Change 2022: annual update of large-scale indicators of the state of the climate system and human influence

Indicators of Global Climate Change 2022: annual update of large-scale indicators of the state of the climate system and human influence | Biodiversité | Scoop.it

Abstract. Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) assessments are
the trusted source of scientific evidence for climate negotiations taking
place under the United Nations Framework Convention on Climate Change (UNFCCC), including the first global stocktake under the Paris Agreement that will conclude at COP28 in December 2023. Evidence-based decision-making needs to be informed by up-to-date and timely information on key indicators of the state of the climate system and of the human influence on the global climate system.

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via @valmasdel "Où en sommes-nous vis-à-vis de l’influence humaine sur le climat planétaire ? Disposer d’éléments factuels, fiables, et régulièrement réactualisés est important pour éclairer l’action pour le climat" Earth System Science Data  Volume 15, issue  6  2295–2327, 2023 https://doi.org/10.5194/essd-15-2295-2023 via @ESSD_journal

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Conférence internationale sur le risque climatique, la vulnérabilité et le développement de la résilience- UNESCO

Conférence internationale sur le risque climatique, la vulnérabilité et le développement de la résilience- UNESCO | Biodiversité | Scoop.it

La Conférence vise à combler le fossé entre la science, les politiques et la prise de décision afin de soutenir un développement efficace de la résilience. Elle ne se limite pas à l'évaluation de la vulnérabilité et des risques climatiques, mais aborde également les défis liés à l'accélération et à la mise à l'échelle de solutions d'adaptation innovantes, au financement du climat et au rôle émergent de la participation des citoyens et de la science ouverte. 

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via @unescoWATER 19-21 avril 2023, Siège de l'UNESCO, et en ligne, programme

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Making forest data fair and open - Nature Ecology & Evolution

Making forest data fair and open - Nature Ecology & Evolution | Biodiversité | Scoop.it
Data on tropical forests are in high demand. But ground forest measurements are hard to sustain and the people who make them are extremely disadvantaged compared to those who use them. We propose a new approach to forest data that focuses on the needs of data originators, and ensures users and funders contribute properly.
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de Lima, R.A.F., Phillips, O.L., Duque, A. et al. Making forest data fair and open. Nat Ecol Evol (2022). https://doi.org/10.1038/s41559-022-01738-7

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Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement

Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement | Biodiversité | Scoop.it

So-called “big-data” approaches have revolutionized fields of research from astronomy to genetics. Such approaches are not limited to fields that seem inherently technical, because the combination of rapid data collection and advanced analytical techniques could be applied to almost any scientific question. Nathan et al. reviewed how these modern approaches are being applied to the very old field of animal tracking and monitoring. Large-scale data collection can reveal details about how animals use their environment and interact with each other that were impossible to explore previously.

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Science • 18 Feb 2022 • Vol 375, Issue 6582DOI: 10.1126/science.abg1780
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Le partage des données vu par les chercheurs : une approche par la valeur - Les Enjeux de l'information et de la communication

Le partage des données vu par les chercheurs : une approche par la valeur - Les Enjeux de l'information et de la communication | Biodiversité | Scoop.it

Le propos de cet article porte sur la compréhension des logiques qui interviennent dans la définition de la valeur des données de la recherche, celles-ci pouvant avoir une influence sur les critères déterminant leur motivation au partage.


Via Service documentaire Observatoire Midi Pyrénées
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Auteur : Rebouillat Violaine, Les Enjeux de l’Information et de la Communication, n°22/1, 2021, p.35 à 53, consulté le mardi 20 juillet 2021.

Voir aussi, via @Service documentaire Observatoire Midi Pyrénées : l'article Ouvrir la Science - Recherche Data Gouv : plateforme nationale fédérée des données de la recherche

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Open data: l’IGN libère ses données - ZDNet

Open data: l’IGN libère ses données - ZDNet | Biodiversité | Scoop.it
L’Institut national de l’information géographique et forestière (IGN) diffusera ses données sous licence libre à partir de janvier 2021.
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Communiqué de presse de l'IGN : https://www.ign.fr/sites/default/files/2020-12/cp_gratuite_donnees_2020.pdf

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Citizen science and citizen engagement - Publications Office of the EU

Citizen science and citizen engagement - Publications Office of the EU | Biodiversité | Scoop.it
Inclusiveness on all levels underpins SwafS. We need science education for all, gender equality in our organisations, ethics and integrity embedded in research, communication we can trust, open science and ultimately place citizens at the core to ensure excellent Research and Innovation to tackle the challenges of today for a better future. Europe can only thrive by matching the immense potential of science with the values, needs, and aspirations of society. Horizon Europe must strengthen efforts to tap into the vast potential citizens have to offer and ensure effective cooperation between science and society. This document reports on the Horizon 2020 Science with and for Society (SwafS), citizen science and citizen engagement project portfolio results.
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Publié: 2020-07-21 par la Direction générale de la recherche et de l'innovation (Commission européenne)

Auteurs : Delaney, NiamhTornasi, ZenoWarin, Colombe

https://ec.europa.eu/info/sites/info/files/research_and_innovation/research_by_area/documents/ec_rtd_swafs_report-citizen_science.pdf

 

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Le Parc national des Écrins déconfine ses données de biodiversité

Le Parc national des Écrins déconfine ses données de biodiversité | Biodiversité | Scoop.it
La connaissance est un bien commun qui se partage. Ce pourrait être l'adage du pôle "système d'informations" du Parc national qui, depuis plusieurs années, organise son travail pour favoriser cette diffusion auprès du plus grand nombre, notamment en utilisant des outils "libres". Après avoir modernisé ses outils et bases de données de faune et de flore en développant l'outil libre (opensource) GeoNature, le Parc national des Ecrins diffuse ses observations de biodiversité sur le portail Biodiv'Ecrins depuis 2016.
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A consulter :

GeoNature Biodiv'Ecrins

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La forêt tropicale de Bornéo sur écoute 24 heures sur 24

La forêt tropicale de Bornéo sur écoute 24 heures sur 24 | Biodiversité | Scoop.it
Un système de surveillance, le SAFE Project, analyse en continu les sons de la forêt tropicale à l’aide d’un algorithme.

Avec de premiers résultats. « L’analyse des sons enregistrés permet de quantifier les évolutions dans le temps de la qualité des habitats », explique le scientifique, Sarab Sethi.

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L'article du Monde est réservé aux abonnés dans sa version complète.

Pour en savoir plus : https://www.safeproject.net/

Téléchargez par exemple cette thèse Shiarella_2018_MSc_Thesis_-_gibbon_acoustic_detection.pdf

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Bioinvasions Records - Issue 3 (2019)

Bioinvasions Records - Issue 3 (2019) | Biodiversité | Scoop.it

BioInvasions Records is an open access, rapid peer-reviewed international journal of field research on biological invasions in aquatic and terrestrial ecosystems from around the world. BioInvasions Records is devoted primarily to publication of research and data papers on records of non-native species. The journal provides the opportunity of timely publication of first records of aquatic and terrestrial invaders and other relevant information needed for online databases, decision support and early warning systems.

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