Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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Ensemble pour une donnée géographique sur l'eau ouverte et interopérable - Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau

Ensemble pour une donnée géographique sur l'eau ouverte et interopérable - Sandre - Portail national d'accès aux référentiels sur l'eau | Biodiversité | Scoop.it
Ce document illustre les données géographiques de référence diffusées par le SANDRE par des cartes, des chiffres clés ou encore des applications métiers faites par les partenaires du Système d'Information * sur l'Eau.
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Atlas_referentiels_geographiques_Sandre_2022.pdf

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La France devient le 2e pays contributeur du système mondial d’information sur la biodiversité

La France devient le 2e pays contributeur du système mondial d’information sur la biodiversité | Biodiversité | Scoop.it
Actualité INPN - Inventaires d'espèces -

Le GBIF (Global Biodiversity Information Facility, ou Système mondial d'information sur la biodiversité) est un réseau international dont le but est de mettre à disposition le maximum de données primaires sur la biodiversité via le portail www.gbif.org, de façon libre et gratuite.L’INPN (plateforme nationale du Système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP) contribue au GBIF depuis plusieurs années, en partageant au niveau international les données d’occurrences d’espèces rassemblées par les producteurs de données français sur le territoire national, métropole et outre-mer inclus.

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Voir aussi OpenObs

Consulter @GBIF @gbiffrance et http://www.gbif.fr/

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Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement

Big-data approaches lead to an increased understanding of the ecology of animal movement | Biodiversité | Scoop.it

So-called “big-data” approaches have revolutionized fields of research from astronomy to genetics. Such approaches are not limited to fields that seem inherently technical, because the combination of rapid data collection and advanced analytical techniques could be applied to almost any scientific question. Nathan et al. reviewed how these modern approaches are being applied to the very old field of animal tracking and monitoring. Large-scale data collection can reveal details about how animals use their environment and interact with each other that were impossible to explore previously.

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Science • 18 Feb 2022 • Vol 375, Issue 6582DOI: 10.1126/science.abg1780
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Parution d'une nouvelle description topographique du réseau hydrographique de métropole : la BD TOPAGE®

Parution d'une nouvelle description topographique du réseau hydrographique de métropole : la BD TOPAGE® | Biodiversité | Scoop.it

L'eau est un enjeu et la préservation de ses milieux est essentielle. Pour mieux connaître et protéger l'hydrographie terrestre (rivières et écoulements, plans d'eau...) l'IGN et l'OFB se sont associés afin de constituer un référentiel hydrographique de métropole unique, la base de données TOPAGE®, dont la première édition est parue et diffusée sur le site du Service d'administration nationale des données et référentiels sur l'eau sous licence ouverte de réutilisation Etalab.

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Le Parc national des Écrins déconfine ses données de biodiversité

Le Parc national des Écrins déconfine ses données de biodiversité | Biodiversité | Scoop.it
La connaissance est un bien commun qui se partage. Ce pourrait être l'adage du pôle "système d'informations" du Parc national qui, depuis plusieurs années, organise son travail pour favoriser cette diffusion auprès du plus grand nombre, notamment en utilisant des outils "libres". Après avoir modernisé ses outils et bases de données de faune et de flore en développant l'outil libre (opensource) GeoNature, le Parc national des Ecrins diffuse ses observations de biodiversité sur le portail Biodiv'Ecrins depuis 2016.
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A consulter :

GeoNature Biodiv'Ecrins

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La forêt tropicale de Bornéo sur écoute 24 heures sur 24

La forêt tropicale de Bornéo sur écoute 24 heures sur 24 | Biodiversité | Scoop.it
Un système de surveillance, le SAFE Project, analyse en continu les sons de la forêt tropicale à l’aide d’un algorithme.

Avec de premiers résultats. « L’analyse des sons enregistrés permet de quantifier les évolutions dans le temps de la qualité des habitats », explique le scientifique, Sarab Sethi.

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L'article du Monde est réservé aux abonnés dans sa version complète.

Pour en savoir plus : https://www.safeproject.net/

Téléchargez par exemple cette thèse Shiarella_2018_MSc_Thesis_-_gibbon_acoustic_detection.pdf

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StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution

StoX: An open source software for marine survey analyses - Johnsen 2019 - Methods in Ecology and Evolution | Biodiversité | Scoop.it

Scientists across the globe conduct survey programs to monitor and characterize abundance, population structure, biodiversity and geographical distributions. To assess the state of marine fish and zooplankton, population surveys are often repeated annually using standardized sampling protocols and analysis techniques to establish trustworthy stock status. However, although transparency and repeatability are recognised as important principles of this process, it is often difficult to obtain comprehensive documentation of metadata and data processing steps. This is particularly challenging for workflows that include manual processing steps.

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Portail open data de l'ADEME

Portail open data de l'ADEME | Biodiversité | Scoop.it

Pour répondre aux obligations réglementaires (Loi pour une République numérique) mais également pour accompagner la Transition énergétique et écologique, l’Agence a décidé de mettre à disposition des entreprises, des collectivités locales, des pouvoirs publics et du grand public, ses données afin de leur permettre de progresser dans leur démarche environnementale.

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Outre les questions du champ d'action strict de l'Ademe, on trouve aussi le travail sur les Représentations sociales du changement climatique : 19 ème vague Focus dirigeants d'entreprises de plus de 50 salariés, mise à jour juillet 2019.

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Connecting data and expertise: a new alliance for biodiversity knowledge

Connecting data and expertise: a new alliance for biodiversity knowledge | Biodiversité | Scoop.it

There has been major progress over the last two decades in digitising historical knowledge of biodiversity and in making biodiversity data freely and openly accessible. Interlocking efforts bring together international partnerships and networks, national, regional and institutional projects and investments and countless individual contributors, spanning diverse biological and environmental research domains, government agencies and non-governmental organisations, citizen science and commercial enterprise.

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Forum TIC des espaces naturels - 3 et 4 Juin 2019 à Montpellier 

Forum TIC des espaces naturels - 3 et 4 Juin 2019 à Montpellier  | Biodiversité | Scoop.it

Ce séminaire s'adresse aux membres de l'AFB, aux chargés de mission, aux collectivités territoriales, aux scientifiques et toutes personnes pour qui les TIC sont devenues incontournables et qui sont à la recherche de nouveaux outils (pour l'établissement des chartes, la modélisation de bases de données, la communication via les nouvelles technologies).

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L'appel à proposition est ouvert. A vos outils, solutions, démarches innovantes pour la biodiversité dans un monde open source. http://forum-tic.afbiodiversite.fr 

Retour-arrière sur les sujets des précédentes éditions : les interventions sont en ligne : http://forum-tic.afbiodiversite.fr/fr/precedentes-editions

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Accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité - Global Biodiversity Information Facility 

Accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité - Global Biodiversity Information Facility  | Biodiversité | Scoop.it

GBIF is an international network and research infrastructure funded by the world’s governments and aimed at providing anyone, anywhere, open access to data about all types of life on Earth.

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A savoir : via  @INPN_MNHN

1 Milliard d’observations d'#espèces partagées au niveau mondial ! La milliardième donnée diffusée par le @GBIF (système mondial d'information sur la biodiversité) est une donnée française transmise par l'INPN !  https://inpn.mnhn.fr/actualites/lire/9061  @gbiffrance @AFBiodiversite @Le_Museum
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Mangeoire pour oiseau connectée !

Nature Tv était à Marseille pour rencontrer Olivier Rovellotti, directeur de Natural Solutions, pour parler de son projet de mangeoire connectée.

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Une video de 5 minutes publiée le 29 juil. 2017.
Suivez @orovellotti sur Twitter
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Tracking Invasive Alien Species (TrIAS)

Tracking Invasive Alien Species (TrIAS) | Biodiversité | Scoop.it
With TrIAS we aim to build an open data-driven framework to support policy on invasive species
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Ceci est le wiki du projet sur lequel les scientifiques partagent leurs articles et fichiers.
Repéré ici par ex cet article "Seven Recommendations to Make Your Invasive Alien Species Data More Useful" http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fams.2017.00013/full
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Les sciences participatives à la rescousse des cours d’eau qui s’assèchent - INRAE

Les sciences participatives à la rescousse des cours d’eau qui s’assèchent - INRAE | Biodiversité | Scoop.it
COMMUNIQUE DE PRESSE - L’application de sciences participatives DRYRivERS montre déjà des premiers résultats ! Déployée à l’échelle internationale en 2022, elle enregistre en 1 an plus de 4000 contributions. Un ensemble de données en open-source, accessibles à tous via un simple site web. Un démarrage encourageant pour la préservation et la gestion de nos rivières, à l’échelle du globe.
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Site Web de DRYvER https://www.dryver.eu/app

via @INRAE_Lyon_Gre et @DRYvER_H2020

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Science ouverte: 10 millions de données acquises par l’ sur le milieu marin rendues publiques

Science ouverte: 10 millions de données acquises par l’ sur le milieu marin rendues publiques | Biodiversité | Scoop.it
Chaque jour, l’Ifremer et ses partenaires* collectent, analysent, utilisent et partagent des milliers de données sur les milieux marins et leur santé. Ces données sont aujourd’hui disponibles via le système d’information optimisé Surval accessible depuis le site internet data.gouv.fr. L’ouverture de ces données à la société répond aux engagements de l’Ifremer en tant que signataire de la Charte d’ouverture à la société et s’inscrit dans le cadre du deuxième Plan national pour la science ouverte.
DocBiodiv's insight:

Accès aux données d'environnement marin et littoral https://wwz.ifremer.fr/surval/

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Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science

Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science | Biodiversité | Scoop.it

In the French West Indies, more than 20 species of cetaceans have been observed over the last decades. The recognition of this hot spot of biodiversity of marine mammals observed in the French Exclusive Economic Zone of the West Indies motivated the French government to create in 2010 a marine protected area (MPA) dedicated to the conservation of marine mammals: the Agoa sanctuary. Threats that cetacean populations face are multiple but well-documented. Cetacean conservation can only be achieved if relevant and reliable data are available, starting by occurrence data. 

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Lire toutes les explications de l'in des auteurs :  @MegaFaunMar_DNA "Notre travail sur le recensement des observations de cétacés au large de la Guadeloupe vient d'être publié en libre accès dans Biodiversity Data Journal"

Coché L, Arnaud E, Bouveret L, David R, Foulquier E, Gandilhon N, Jeannesson E, Le Bras Y, Lerigoleur E, Lopez PJ, Madon B, Sananikone J, Sèbe M, Le Berre I, Jung J-L (2021) Kakila database: Towards a FAIR community approved database of cetacean presence in the waters of the Guadeloupe Archipelago, based on citizen science. Biodiversity Data Journal 9: e69022. https://doi.org/10.3897/BDJ.9.e69022

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La carte du Morbihan - Conservatoire botanique national de Brest

La carte du Morbihan - Conservatoire botanique national de Brest | Biodiversité | Scoop.it

La carte des grands types de végétation du Morbihan est en accès libre depuis décembre 2020. 684 396 hectares ont été cartographiés.

Quelle analyse peut-on faire du territoire ? Le paysage du Morbihan est fortement impacté par l’activité humaine, notamment au nord-est. Les milieux artificialisés (cultures, vergers, cultures, parcs et jardins, bâti, routes) représentent 53% du territoire dont 43% dédiés aux cultures agricoles.

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On en parle déjà dans la presse ! "La Bretagne a désormais sa carte complète de ses grands types de végétation" https://www.francebleu.fr/infos/environnement/la-bretagne-a-desormais-sa-carte-complete-de-ses-grands-types-de-vegetation-1607611088

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Olivier Gimenez on Twitter: "Avec des collègues de @INRAE_France, @Supagro, #CERPAM et @OFBiodiversite, nous proposons une analyse descriptive du phénomène de concentration d’attaques de loup su...

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 Analyse de la base de données nationale Géoloup en prélude à un article à publier dans une revue scientifique - 3 avril 2020 Olivier Gimenez, Olivier Bonnet, Laurent Garde,Charles-Henri Moulin, Marie-Odile Nozières-Petit, Christophe Duchamp, Michel Meuret.

Le site web pour toutes les infos et actualités

https://www.loupfrance.fr

 

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Bioinvasions Records - Issue 3 (2019)

Bioinvasions Records - Issue 3 (2019) | Biodiversité | Scoop.it

BioInvasions Records is an open access, rapid peer-reviewed international journal of field research on biological invasions in aquatic and terrestrial ecosystems from around the world. BioInvasions Records is devoted primarily to publication of research and data papers on records of non-native species. The journal provides the opportunity of timely publication of first records of aquatic and terrestrial invaders and other relevant information needed for online databases, decision support and early warning systems.

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Sciences citoyennes : des promesses pas (encore) tout à fait réalisées

Sciences citoyennes : des promesses pas (encore) tout à fait réalisées | Biodiversité | Scoop.it
Mélanger citoyens et scientifiques pour mener à bien des projets scientifiques, comment ça marche ? Qui y trouve le plus d’avantages ?
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Par Bastien Castagneyrol , Chercheur en écologie, Inra

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Flotrop, une contribution massive aux données botaniques d’Afrique tropicale - CIRAD

Flotrop, une contribution massive aux données botaniques d’Afrique tropicale - CIRAD | Biodiversité | Scoop.it

Flotrop, une contribution massive aux données botaniques d’Afrique tropicale : Le Cirad vient de partager des données botaniques historiques du nord de l’Afrique tropicale grâce à la parution d’un data paper publié dans Nature Scientific Data.
En couvrant une période allant de 1920 à 2012, ces données constituent un outil puissant et unique pour comprendre la crise de la biodiversité et les impacts du changement climatique sur la flore sahélienne.


Via Agrodoc Ouest
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Article paru dans Scientific Data volume 6, Article number: 118 (2019) https://www.nature.com/articles/s41597-019-0120-8

L'un des auteurs à suivre sur Twitter @s_taugourdeau

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GBIF France

GBIF France | Biodiversité | Scoop.it
En tant que membre du Système mondial d'information sur la biodiversité (GBIF) depuis sa création en 2001, la France s’engage à promouvoir l'accès libre et ouvert aux données sur la biodiversité, via Internet.
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Interface de recherche sur le portail français http://recherche.gbif.fr/search

Voir le site du GBIF | Global Biodiversity Information Facility https://www.gbif.org/

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Le Big Data a permis de créer la 1ère carte de végétation du monde

Le Big Data a permis de créer la 1ère carte de végétation du monde | Biodiversité | Scoop.it

L’intelligence artificielle et les analyses Big Data ont permis de créer la première carte de la végétation de la planète Terre. Une précieuse ressource qui va permettre aux scientifiques de mieux comprendre la biodiversité de notre planète, de déterminer quels sont les meilleurs endroits pour l’agriculture, et quelles sont les zones les plus touchées par le réchauffement climatique.

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Les données des sportifs : utiles aux gestionnaires ?

Les données des sportifs : utiles aux gestionnaires ? | Biodiversité | Scoop.it
Le monde des Big data[1] n’a pas fini de nous étonner… Largement utilisée par les sportifs du monde entier (essentiellement les cyclistes, trailers ou autres riders), l’application Strava © permet à ces derniers d’enregistrer leurs parcours et les données de performance associées (vitesse, temps, etc.). Collectées et analysées par de puissants algorithmes, ces données nettoyées …
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Lutte contre le trafic d’espèces menacées, open data et biens communs numériques

Lutte contre le trafic d’espèces menacées, open data et biens communs numériques | Biodiversité | Scoop.it
Le Pôle biodiversité forêts océans du Ministère de l’Europe et des Affaires étrangères et Open Knowledge France annoncent un partenariat afin de valoriser les données ouvertes et biens commun…
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