Biodiversité

Des approches modernes du suivi et de la surveillance des animaux sont possibles grâce au développement de technologies qui génèrent de vastes ensembles de données à haute résolution. Ces technologies, ainsi que les progrès des méthodes analytiques, permettent aux biologistes de suivre les mouvements des mammifères, des oiseaux et des poissons en liberté à des échelles sans précédent.

Bonne lecture !

Le jeudi 08 juin sera célébré la Journée mondiale de l'océan.

A cette occasion, l'OiEau a souhaité mettre à votre disposition un document synthétique présentant, en quelques chiffres significatifs, l'impact de l'activité humaine sur ces vastes étendues d'eau salée qui couvrent une grande partie de la surface du globe terrestre.

Cette formation de cinq jours a pour objectif de former de jeunes chercheurs/chercheuses aux techniques de méta-analyses et des méthodes des revues/cartes systématiques appliquées au domaine de la biodiversité. Ce sera aussi l’occasion de se familiariser avec les différents outils disponibles à la fois bibliographiques (comme WOS, Zotero/Mendeley/Endnote) et statistiques (packages R : metaDigisitise, metafor, etc.) nécessaires pour entreprendre une revue et méta-analyses.

Despite substantial progress in understanding global biodiversity loss, major taxonomic and geographic knowledge gaps remain. Decision makers often rely on expert judgement to fill knowledge gaps, but are rarely able to engage with sufficiently large and diverse groups of specialists. To improve understanding of the perspectives of thousands of biodiversity experts worldwide, we conducted a survey and asked experts to focus on the taxa and freshwater, terrestrial, or marine ecosystem with which they are most familiar. We found several points of overwhelming consensus (for instance, multiple drivers of biodiversity loss interact synergistically) and important demographic and geographic differences in specialists’ perspectives and estimates.

Au sommaire notamment :

Les sols pollués à l’épreuve de l’expertise pédologique

Collecte des données de pratiques agricoles des sites du Réseau de mesures de la qualité des sols

Christel A., Maron P.-A. et L. Ranjard L., 2022 - Méta-analyse sur l’impact des modes de production agricole sur la qualité écologique du sol - Étude et Gestion des Sols, 29, 117-14

Outils d’évaluation de la diversité et de l’activité des vers de terre : de la science participative à la recherche fondamentale

Incendies dévastateurs, réchauffement climatique, fonte irrémédiable de la calotte glaciaire au Groenland, augmentation du niveau de la mer et des températures, épuisement des ressources, disparition des espèces, maladies liées à la pollution, les scientifiques alertent depuis des années sur l’état de la planète. Selon l’Indice planète vivante, outil de référence publié par le WWF tous les deux ans, 68% de la faune sauvage a disparu entre 1970 et 2016. En cause, la destruction d’habitats naturels, en particulier due à l’agriculture.

Souvent considérée comme un ennemi de la planète par beaucoup d’écologistes, la technologie pourrait jouer un rôle crucial en créant des outils de prévention apportant des solutions concrètes pour l’environnement. L’Intelligence Artificielle pourrait donc devenir un allié pour la planète et la conservation des espèces.

Faune sauvage n° 326 : zoom sur le suivi à long terme
Les bases de données à long terme, issues de suivis standardisés conduits parfois depuis près de 50 ans, sont l’une des richesses de l’OFB. Certains phénomènes écologiques ne sont en effet perceptibles que sur le temps long. Ainsi, une recul de plusieurs dizaines d’années est en général nécessaire pour évaluer l’état de conservation de telle ou telle population au sein d'une espèce. Ces éléments sont très précieux dans le cadre des rapportages liés aux différentes directives européennes notamment.

Les oiseaux sont-ils voués à devenir de plus en plus petits ? C’est ce que suggère une étude publiée dans la revue Ecology Letters, mercredi 4 décembre, rendant compte du travail minutieux d’un chercheur américain du Field Museum de Chicago.

Le rétrécissement des oiseaux est, selon une étude, directement corrélé à la température des zones de reproduction.

Le Plan national pour la science ouverte annoncé par Frédérique Vidal, le 4 juillet 2018, rend obligatoire l’accès ouvert pour les publications et pour les données issues de recherches financées sur projets. Il met en place un Comité pour la science ouverte et soutient des initiatives majeures de structuration du paysage concernant les publications et les données. Enfin, il est doté d’un volet formation et d’un volet international qui sont essentiels à la mobilisation des communautés scientifiques et à l’influence de la France dans ce paysage en cours de constitution.

We illustrate how to build spaces of interactions between research and management. We present two case studies we conducted through a long-term collaboration between the Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE; academic/science—a public research laboratory mostly focused on basic ecological questions) and the French Biodiversity Agency (OFB; non-academic/management—a public institute dedicated to biodiversity protection and restauration, under administrative supervision of ecology and agriculture ministries) with biodiversity monitoring in national parks and management of large carnivores in France.

Since 1986, this conference has been an important forum for the exchange of information between statisticians and biologists on analytical techniques and their applications. The focus is usually on the development, understanding and integration of statistical methods for estimation and inference on animal population dynamics and demography, with data on marked individuals (via ringing/banding, DNA sequencing, GPS tags, etc).

Les programmes de surveillance de la biodiversité ne se contentent pas d'informer sur le recul de la biodiversité, ils mettent également en évidence les causes de ces évolutions et suivent les effets des mesures prises. En Suisse, nous bénéficions d'un inventaire de haute qualité qui existe depuis plus de deux décennies. Le Forum Biodiversité Suisse met en évidence la valeur des séries de données collectées sur une longue période pour répondre aux questions actuelles.

Les sciences et recherches participatives recouvrent, au sens large, toutes les formes de production de connaissances scientifiques auxquelles participent, avec des chercheurs, des acteurs de la société civile à titre individuel ou collectif et de façon active et délibérée. Ce premier numéro spécial de NOV'AE alterne des articles de perspectives historiques, des articles thématiques, des présentations de projets et des retours d’expérience.

Au sommaire notamment :

.A bird in the hand: Global-scale morphological trait datasets open new frontiers of ecology, evolution and ecosystem science. Joseph A. Tobias

Van Klink et al. (Reports, 24 April 2020, p. 417) argue for a more nuanced view of insect decline, and of human responsibility for this decline, than previously suggested. However, shortcomings in data selection and methodology raise questions about their conclusions on trends and drivers. We call for more rigorous methodology to be applied in meta-analyses of ecological data.

By Marion Desquilbet, Laurence Gaume, M. Grippa, Régis Céréghino, JF Humbert, JM Bonmatin, PACornillon, Dirk Maes, Hans Van Dyck, David Goulson Science18 Dec 2020

Les mammifères marins, par leur position trophique, sont des espèces sentinelles de la qualité de l’environnement marin. Pour évaluer l’état de conservation de ces populations – requis dans le cadre de la directive-cadre «Stratégie pour le milieu marin» (DCSMM), mais aussi de la directive «Habitats» et de plusieurs conventions internationales –, il existe différents indicateurs produits par des méthodologies complémentaires, dont l’étude des individus échoués. Le suivi à long terme des échouages de mammifères marins est associé à la gestion d’une banque de prélèvements et aux analyses biologiques (biodémographie, écologie trophique, contaminants...). Structuré en un réseau national, il permet de documenter les tendances spatio-temporelles des effectifs d’échouages et des pressions anthropiques pesant sur les mammifères marins.

Dossier coordonné par Céline Pascual-Espuny (IMSIC, Aix-Marseille Université), Andrea Catellani (LASCO, Université catholique de Louvain) et Béatrice Jalenques-Vigouroux (LERASS, INSA Toulouse). À la reconquête du lien entre les sciences et la Cité, d’une pratique élargie et ouverte de la science, la recherche participative a connu un essor et une amplitude sans précédent ces dernières années. D’une question et d’une méthodologie de recherche, la démarche a ensuite évolué vers une approch