Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise

CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise | Biodiversité | Scoop.it
Le parc naturel marin d'Iroise accueille de nombreuses espèces de cétacés: dauphins communs, marsouins communs, rorquals communs, dauphins de Risso, globicéphales noirs, le parc et l'ENSTA Bretagne mettent en place un protocole d'écoute passive pour mieux connaitre toutes ces espèces sans les déranger.
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Ecoutez https://soundcloud.com/ofbiodiversite/lecholocalisation-chez-le-grand-dauphin-tursiops-truncatus

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Recenser les oiseaux, identifier les plantes : les sciences participatives font-elles vraiment avancer la recherche ?

Recenser les oiseaux, identifier les plantes : les sciences participatives font-elles vraiment avancer la recherche ? | Biodiversité | Scoop.it
Les sciences participatives invitent tout un chacun à apporter sa pierre à l'édifice de la recherche. Mais comment déterminer l'apport réel de cette pratique aux connaissances ?
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Auteurs : Bastien Castagneyrol Chercheur en écologie, Inrae et Baptiste Bedessem Chargé de recherche, Inrae

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Sur les traces du Desman des Pyrénées

Sur les traces du Desman des Pyrénées | Biodiversité | Scoop.it

A cause des activités humaines qui ont modifié le milieu, fragmenté l’habitat et les populations de l’espèce (artificialisation des berges et des débits, construction de barrages hydroélectriques, pollutions...), l’aire de répartition du Desman des Pyrénées a diminué de plus de 50 % en 30 ans. Pour enrayer son déclin et mieux connaître cette espèce, un Plan national d’actions a vu le jour en 2021.

Fin septembre 2023, une opération de suivi du Desman des Pyrénées a été mise en œuvre au sein de la Réserve nationale de chasse et de faune sauvage d’Orlu afin de mieux comprendre cette mystérieuse espèce.

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Voir aussi sir le site du Parc national des Pyrénées

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Le blog des campagnes aériennes MAMO - Etude de la mégafaune marine en Manche orientale

Le blog des campagnes aériennes MAMO - Etude de la mégafaune marine en Manche orientale | Biodiversité | Scoop.it

Etude de la mégafaune marine en Manche orientale, en particulier dans le Parc naturel marin des estuaires picards et de la mer d’Opale. Pour compléter les connaissances à une échelle spatiale et temporelle plus adapté aux questions du Parc, cette campagne d’acquisition de données via l’observation aérienne vise les oiseaux marins, les mammifères marins, et d'autres espèces mobiles visibles en surface (poissons, raies, ...), les macrodéchets flottants ainsi que les navires.

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via @sophie_laran

Plus d’informations sur le projet MAMO :  https://parc-marin-epmo.fr/editorial/connaitre-la-megafaune-marine-en-manche-orientale

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On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys

On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys | Biodiversité | Scoop.it

Abstract: Designing a large-scale multispecies survey presents significant challenges due to its multivariate, multiscale, and often multiobjective nature. Because it is impractical to measure or observe all variables of interest at every location in the survey area, spatial sampling is crucial. To ensure a statistically sound survey, free of assumptions, randomization of the selection of spatial sampling units is required. In a large-scale survey, minimizing travel costs requires multistage sampling in which nearby sampling units are grouped within higher-level sampling units.

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Philippe Aubry, Gwenaël Quaintenne, Jeremy Dupuy, Charlotte Francesiaz, Matthieu Guillemain, Alain Caizergues, Ecological Informatics,Volume 77,2023, https://doi.org/10.101/j.ecoinf.2023.102229 via @C_Francesiaz

Article en lien avec l’enquête Limat qui a pour but d’estimer les effectifs nicheurs des différentes espèces d’anatidés et de limicoles sur le territoire métropolitain https://professionnels.ofb.fr/fr/node/1336 via @GSouchay

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Une nouvelle étape franchie dans la cartographie 3D de la France - Portail IGN

Une nouvelle étape franchie dans la cartographie 3D de la France - Portail IGN | Biodiversité | Scoop.it

Dans le cadre du programme national de cartographie 3D du territoire français, l’IGN publie les premiers nuages de points LiDAR HD « classés » en données ouvertes et gratuites sur le site Géoservices de l’IGN. Cette classification des données LiDAR permet de distinguer le sol et les différents éléments du sursol (végétation, bâtiments, équipements…). 

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Communiqué de presse - 21 juin 2023 https://geoservices.ign.fr/lidarhd

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One Forest Summit : "Aujourd'hui, on est face à deux crises : sur le réchauffement climatique et la biodiversité."

One Forest Summit : "Aujourd'hui, on est face à deux crises : sur le réchauffement climatique et la biodiversité." | Biodiversité | Scoop.it

Le One Forest Summit se tient aujourd'hui et demain à Libreville au Gabon. Sabrina Krief, professeure au Museum d'Histoire naturelle, vétérinaire, spécialiste des grands singes et Gilles Kleitz, directeur exécutif de l'Agence française du Développement, sont les invités du 7h50 pour en parler.

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Suivre le One Forest Summit 1er & 2 Mars 2023 à Libreville, Gabon via @oneplanetsummit et en direct /https://oneforestsummitmedia.com/transmissions-en-direct/

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Nouvelle diffusion de données piscicoles sur l'Inventaire national du patrimoine naturel

Nouvelle diffusion de données piscicoles sur l'Inventaire national du patrimoine naturel | Biodiversité | Scoop.it
Les résultats de près de 50 000 opérations de pêche à l'électricité en cours d'eau, gérées via l'application de saisie des données piscicoles et environnementales (ASPE), sont disponibles sur l'INPN
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Consulter le  portail Naïades et prochainement via l'API Poisson de la plateforme Hub'Eau

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Le suivi des moules perlières grâce à la pêche électrique

Le suivi des moules perlières grâce à la pêche électrique | Biodiversité | Scoop.it
Pour connaître l’état des milieux de vie des moules perlières de la Haute vallée de l’Arn (34 et 81), l’Office français de la biodiversité (OFB) a organisé trois journées de pêche électrique en juillet 2022.

Les moules perlières (Margaritifera margaritifera) sont des mollusques fragiles, menacés entre autres par la pollution, l’altération des cours d’eau ou encore le piétinement. Elles sont dépendantes du bon état écologique des rivières et de la présence de truites, hôtes indispensables pour la croissance de leurs larves.

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European primary forest database v2.0

European primary forest database v2.0 | Biodiversité | Scoop.it

Primary forests, defined here as forests where the signs of human impacts, if any, are strongly blurred due to decades without forest management, are scarce in Europe and continue to disappear. Despite these losses, we know little about where these forests occur. Here, we present a comprehensive geodatabase and map of Europe’s known primary forests. Our geodatabase harmonizes 48 different, mostly field-based datasets of primary forests, and contains 18,411 individual patches (41.1 Mha) spread across 33 countries. When available, we provide information on each patch (name, location, naturalness, extent and dominant tree species) and the surrounding landscape (biogeographical regions, protection status, potential natural vegetation, current forest extent).

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Sabatini, F.M., Bluhm, H., Kun, Z. et al. European primary forest database v2.0. Sci Data 8, 220 (2021). https://doi.org/10.1038/s41597-021-00988-7

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Les requins de récif brillent par leur absence - IRD le Mag'

Les requins de récif brillent par leur absence - IRD le Mag' | Biodiversité | Scoop.it
Les activités humaines ont un impact global sur les requins de récif. La création de sanctuaires et d'aires marines protégées de très grande taille font partie des mesures susceptibles de restaurer les populations de ces prédateurs essentiels à l'équilibre des écosystèmes côtiers des zones tropicales.
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MacNeil, M.A., Chapman, D.D., Heupel, M. et al. Global status and conservation potential of reef sharks. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2519-y

" « On s’attend… à ce qu’il y ait des requins sur tous les récifs coralliens du monde et il est très inquiétant de découvrir qu’il n’y en a aucun dans 20 % des récifs que nous avons surveillés », a expliqué un des auteurs de l’étude" via https://www.20minutes.fr/planete/2827595-20200723-declin-inquietant-populations-requins-selon-chercheurs#xtor=RSS-149

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Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics

Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics | Biodiversité | Scoop.it

Time-lapse cameras facilitate remote and high-resolution monitoring of wild animal and plant communities, but the image data produced require further processing to be useful. Here we publish pipelines to process raw time-lapse imagery, resulting in count data (number of penguins per image) and ‘nearest neighbour distance’ measurements. The latter provide useful summaries of colony spatial structure (which can indicate phenological stage) and can be used to detect movement – metrics which could be valuable for a number of different monitoring scenarios, including image capture during aerial surveys. We present two alternative pathways for producing counts: (1) via the Zooniverse citizen science project Penguin Watch and (2) via a computer vision algorithm (Pengbot), and share a comparison of citizen science-, machine learning-, and expert- derived counts.

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Un papier qui parle données, comptage par piège photographique, projet de science participative concernant des pingouins, technique et matériel, transfert de l'expérience dans d'autres scenarios de suivi et inventaire !

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Global Change Biology

Global Change Biology | Biodiversité | Scoop.it

Projecting terrestrial biodiversity intactness with GLOBIO 4

Aafke M. Schipper and al.

Temperature change as a driver of spatial patterns and long‐term trends in chironomid (Insecta: Diptera) diversity

Stefan Engels

Secondary forest fragments offer important carbon and biodiversity cobenefits

Fabio A. R. Matos

Soil fauna diversity increases CO2 but suppresses N2O emissions from soil

Ingrid M. Lubbers

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A scalable and transferable approach to combining emerging conservation technologies to identify biodiversity change after large disturbances

Ecological disturbances are becoming more extensive and intensive globally, a trend exemplified by ‘megafires’ and industrial deforestation, which cause widespread losses of forest cover. Yet the hypothesis that contemporary environmental disturbances are affecting biodiversity has been difficult to test directly.

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Wood, C. M., Socolar, J., Kahl, S., Peery, M. Z., Chaon, P., Kelly, K., Koch, R. A., Sawyer, S. C., & Klinck, H. (2024). Journal of Applied Ecology, 00, 111. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14579
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La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle

La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle | Biodiversité | Scoop.it

Face aux changements globaux actuels, l’enjeu des suivis de la dynamique de la biodiversité est croissant et entraîne une forte demande d’évaluations rapides et détaillées des changements de biodiversité. L’identification moléculaire des espèces est de plus en plus utilisée pour remplacer ou compléter les méthodes de surveillance écologique plus classiques. Le metabarcoding est considéré comme un outil d’inventaire, de connaissance de la biologie (prédateurs proies, pollinisateurs, etc.) et même de la découverte de l’histoire d’écosystèmes. Il permet de générer des données sur la biodiversité de manière rapide, précise et fiable, sur un large éventail d’organismes.

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LE BORGNE H. & BOUGET C. 2024. — La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre. Naturae 2024 (3): 31-67. https://doi.org/10.5852/naturae2024a3

Bernadette Cassel's curator insight, February 20, 2:17 PM

 

Mots-clés :

Surveillance de la biodiversité, metabarcoding, ADN environnemental, biologie des espèces

 

 

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How AI can help to save endangered species

How AI can help to save endangered species | Biodiversité | Scoop.it
Scientists are using artificial intelligence to fight biodiversity loss by analysing vast amounts of data, monitoring ecosystems and spotting trends over time.
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Auteur Tosin Thompson Nature 623, 232-233 (2023)

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-023-03328-4

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Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France

Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France | Biodiversité | Scoop.it

We illustrate how to build spaces of interactions between research and management. We present two case studies we conducted through a long-term collaboration between the Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE; academic/science—a public research laboratory mostly focused on basic ecological questions) and the French Biodiversity Agency (OFB; non-academic/management—a public institute dedicated to biodiversity protection and restauration, under administrative supervision of ecology and agriculture ministries) with biodiversity monitoring in national parks and management of large carnivores in France.

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Thibaut CouturierSarah BauduinGuillelme Astruc, & al.05 June 2023, Ecological Solutions and Evidence, Vol.4 https://doi.org/10.1002/2688-8319.12245

Lire aussi "L’OFB et le CNRS bâtissent des ponts entre recherche en écologie et conservation de la biodiversité"

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En trois mois, ce nouveau radar automatique a déjà flashé… plus de 300 000 oiseaux - Ouest France

En trois mois, ce nouveau radar automatique a déjà flashé… plus de 300 000 oiseaux - Ouest France | Biodiversité | Scoop.it

Les oiseaux aussi ont droit à leur radar ! Mais pas pour contrôler leur vitesse, seulement pour les compter. On ne compte que sept appareils de ce type en France. Une nouvelle machine vient d’être installée par la fédération des chasseurs en Presqu’île de Guérande (Loire-Atlantique). Elle sert à mieux estimer les effectifs des oiseaux migrateurs.

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Edition du soir du 28/07/2023

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Programme d’études Colombidés - Bilans annuels

Programme d’études Colombidés - Bilans annuels | Biodiversité | Scoop.it
Ces documents présentent le bilan du suivi des Colombidés mené depuis 2019 au niveau national dans le cadre du programme d'étude dédié à 4 espèces : campagne de baguage et recaptures d’oiseaux bagués, suivi de la reproduction. Les résultats sont mis en perspective avec ceux des années précédentes. D'autres études plus spécifiques liées au programme sont aussi présentées, telles que le suivi des déplacements par voie satellitaire, les analyses isotopiques ou les études des tableaux de chasse.
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Auteur Hervé Lormée, OFB, mai 2023

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Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien

Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien | Biodiversité | Scoop.it

Les baleines à bosse (Megaptera novaeangliae) de l'hémisphère sud migrent chaque année depuis les zones d'alimentation de l'Antarctique vers les zones tropicales où elles se rassemblent pour s'accoupler et mettre bas. Leurs cycles migratoires font l'objet de beaucoup d'intérêt et des suivis satellitaires ont été entrepris en différents points du globe. Si ces routes sont désormais mieux connues, des zones d'ombre demeurent notamment au sud de l'océan Indien.

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Dans le cadre du programme MIROMEN, 11 baleines ont été équipées de balise GPS.

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La pêche scientifique à l’électricité dans les milieux aquatiques continentaux - Guides et protocoles

La pêche scientifique à l’électricité dans les milieux aquatiques continentaux - Guides et protocoles | Biodiversité | Scoop.it
La pêche scientifique à l'électricité est une méthode largement utilisée pour les échantillonnages piscicoles en cours d’eau. Cet ouvrage fournit les éléments de compréhension des phénomènes électriques et de la réaction des poissons soumis à un champ électrique, et synthétise l’ensemble des paramètres à prendre en compte pour réaliser ou exploiter ce type de pêche. Il est le fruit d’une collaboration entre Inrae et l’OFB dans le cadre du pôle OFB-Inrae-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (Miame).
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Pottier G., Azam D., Beaulaton L., Vigneron T., Rives J., Marchand F., Pénil C. 2022. La pêche scientifique à l’électricité dans les milieux aquatiques continentaux. Office français de la biodiversité. Collection Guides et protocoles. 136 pages

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Rescooped by DocBiodiv from La revue de web ornithologique de la LPO Île-de-France
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Pyrénées : Balises GPS, chemins à éviter… Comment faire cohabiter l’emblématique grand tétras et les touristes ?

Pyrénées : Balises GPS, chemins à éviter… Comment faire cohabiter l’emblématique grand tétras et les touristes ? | Biodiversité | Scoop.it
"A Superbagnères, dans la Haute-Garonne, des grands tétras, ces coqs de bruyère rares et emblématiques, sont désormais équipés de balises GPS. L’objectif est de les connaître mieux pour les déranger moins"

Via LPO Île-de-France
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A noter "Avec 20,9% de fréquentation en plus cette année, les Pyrénées passent en tête des destinations montagne préférées des Français. " dans la Semaine des Pyrénées, Patrick Sacristan le 9/09/2021 https://www.lasemainedespyrenees.fr/2021/09/09/bigorre-bilan-tres-positif-pour-les-domaines-npy-et-ses-grands-sites/ via @ClusterMontagne

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Quand l'intelligence artificielle vient au secours de la nature

Quand l'intelligence artificielle vient au secours de la nature | Biodiversité | Scoop.it

Incendies dévastateurs, réchauffement climatique, fonte irrémédiable de la calotte glaciaire au Groenland, augmentation du niveau de la mer et des températures, épuisement des ressources, disparition des espèces, maladies liées à la pollution, les scientifiques alertent depuis des années sur l’état de la planète. Selon l’Indice planète vivante, outil de référence publié par le WWF tous les deux ans, 68% de la faune sauvage a disparu entre 1970 et 2016. En cause, la destruction d’habitats naturels, en particulier due à l’agriculture.

Souvent considérée comme un ennemi de la planète par beaucoup d’écologistes, la technologie pourrait jouer un rôle crucial en créant des outils de prévention apportant des solutions concrètes pour l’environnement. L’Intelligence Artificielle pourrait donc devenir un allié pour la planète et la conservation des espèces.

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Le magazine ActuIA N°2 du dernier trimestre 2020 vient de paraître. Il est disponible en kiosque via @ActuIAFr

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[Biodiversité] Au Centre spatial guyanais, la faune sauvage se porte bien

[Biodiversité] Au Centre spatial guyanais, la faune sauvage se porte bien | Biodiversité | Scoop.it
Dans le cadre d’un partenariat avec le CNES, l’OFB étudie la faune terrestre dans les forêts du Centre spatial guyanais. Un suivi scientifique qui confirme la richesse de cet espace de 700 km2 exceptionnellement préservé.
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INPN Espèces : « Nous avons dépassé nos attentes »

INPN Espèces : « Nous avons dépassé nos attentes » | Biodiversité | Scoop.it

Alors que l’application participative de l’INPN fête sa première année, les coordinateurs Sarah Figuet et Mathias Laville dressent un premier bilan. Tout sourire.

Conçue en 2016 pour découvrir la faune et de la flore autour de chez soi, leurs caractéristiques, répartition ou encore leurs statuts de conservation, l’application INPN Espèces devient participative en 2018. Le principe ? Il suffit d’envoyer avec son smartphone une photo d’un spécimen rencontré dans son jardin, sur son chemin, lors d’une balade – partout ! -, afin qu’un expert puisse l’identifier et vous renvoyer le nom de l’espèce. Il ne s’agît pas de comptage ni de suivis à la différence de ce que nous proposons à Vigie-Nature mais bien de compléter, entre autres, l’inventaire national du patrimoine naturel ou celui de votre commune. 

DocBiodiv's insight:

On continue ? Faites votre choix parmi les "8 observatoires pour tous les curieux de nature !" http://www.vigienature.fr/fr/tous-2932 

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