Biodiversité

Des approches modernes du suivi et de la surveillance des animaux sont possibles grâce au développement de technologies qui génèrent de vastes ensembles de données à haute résolution. Ces technologies, ainsi que les progrès des méthodes analytiques, permettent aux biologistes de suivre les mouvements des mammifères, des oiseaux et des poissons en liberté à des échelles sans précédent.

Vidéo - Les chercheurs du projet Imprint ont équipé trois forêts françaises de centaines de capteurs de température.

Abstract: Designing a large-scale multispecies survey presents significant challenges due to its multivariate, multiscale, and often multiobjective nature. Because it is impractical to measure or observe all variables of interest at every location in the survey area, spatial sampling is crucial. To ensure a statistically sound survey, free of assumptions, randomization of the selection of spatial sampling units is required. In a large-scale survey, minimizing travel costs requires multistage sampling in which nearby sampling units are grouped within higher-level sampling units.

Pour connaître l’état des milieux de vie des moules perlières de la Haute vallée de l’Arn (34 et 81), l’Office français de la biodiversité (OFB) a organisé trois journées de pêche électrique en juillet 2022.

Les moules perlières (Margaritifera margaritifera) sont des mollusques fragiles, menacés entre autres par la pollution, l’altération des cours d’eau ou encore le piétinement. Elles sont dépendantes du bon état écologique des rivières et de la présence de truites, hôtes indispensables pour la croissance de leurs larves.

Au sommaire notamment :

-La stratégie de gestion des espèces exotiques envahissantes du bassin Loire-Bretagne 2014-2020 entre dans sa dernière année. 2020 est donc consacrée à la rédaction du bilan de 7 années d’animation de la stratégie, ainsi qu’à la consultation des acteurs pour réfléchir ensemble à ses perspectives.

-Le Xénope lisse, Xenopus laevis et le Solidage Solidago Gigantea, toutes deux exotiques envahissantes font leur entrée dans le catalogue des retours d'expérience.

Des scientifiques, aidés par Greenpeace, ont équipé dix tortues luth de balise Argos pour suivre leurs migrations. De la Guyane, où elles pondent, jusqu’à leurs zones d’alimentation.

De nombreux pays veulent lutter contre les sargasses, ces algues brunes nauséabondes qui polluent particulièrement le littoral caribéen.

Watercourses are intensively managed in many areas around the world and face serious problems such as increasing population in urban areas i.e. over 50% of the global population lives in cites. In short, and quoting recent papers published, it is expected that the number of people affected by organic pollution will increase from 1.2 billion in 2000 to 2.5 billion in 2050. Wastewater discharges from cities, specially megacities, and intensive livestock due to increased demand on food supply can be considered as main sources of pollution of our rivers and groundwaters.

Alors que le premier seuil de viabilité de l’espèce en France est sur le point d’être atteint avec une population de 500 individus, soit l’objectif fixé par le plan gouvernemental 2018/2023, la méthode de comptage fait toujours polémique chez les éleveurs ou les élus des zones concernées. Ces derniers estiment que les chiffres officiels sont sous-évalués, or ils servent de base de calcul au plafond des grands prédateurs qui pourront être tués légalement pour protéger les troupeaux, soit 10 à 12% de la population lupine recensée. Pour mieux comprendre les méthodes d’investigation employées par le réseau national loup, nous avons suivi une équipe de l’Office national de la chasse et de la faune sauvage, en Savoie, département où pas moins de neuf zones de présence permanente du loup sont localisées.

Face aux changements globaux actuels, l’enjeu des suivis de la dynamique de la biodiversité est croissant et entraîne une forte demande d’évaluations rapides et détaillées des changements de biodiversité. L’identification moléculaire des espèces est de plus en plus utilisée pour remplacer ou compléter les méthodes de surveillance écologique plus classiques. Le metabarcoding est considéré comme un outil d’inventaire, de connaissance de la biologie (prédateurs proies, pollinisateurs, etc.) et même de la découverte de l’histoire d’écosystèmes. Il permet de générer des données sur la biodiversité de manière rapide, précise et fiable, sur un large éventail d’organismes.

Une nappe phréatique, ce n’est pas un lac souterrain. Pour mieux les comprendre et les gérer, les scientifiques tentent de les visualiser en 4D : dans l’espace, mais aussi dans le temps.

We illustrate how to build spaces of interactions between research and management. We present two case studies we conducted through a long-term collaboration between the Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE; academic/science—a public research laboratory mostly focused on basic ecological questions) and the French Biodiversity Agency (OFB; non-academic/management—a public institute dedicated to biodiversity protection and restauration, under administrative supervision of ecology and agriculture ministries) with biodiversity monitoring in national parks and management of large carnivores in France.

La pêche scientifique à l'électricité est une méthode largement utilisée pour les échantillonnages piscicoles en cours d’eau. Cet ouvrage fournit les éléments de compréhension des phénomènes électriques et de la réaction des poissons soumis à un champ électrique, et synthétise l’ensemble des paramètres à prendre en compte pour réaliser ou exploiter ce type de pêche. Il est le fruit d’une collaboration entre Inrae et l’OFB dans le cadre du pôle OFB-Inrae-Institut Agro-UPPA pour la gestion des migrateurs amphihalins dans leur environnement (Miame).

À l’heure où la prise en compte du Desman des Pyrénées, Galemys pyrenaicus É. Geoffroy Saint-Hilaire, 1811 dans toutes les procédures environnementales devient la norme, il convient de proposer des protocoles efficaces pour permettre le suivi de l’espèce. Outre la recherche de fèces, d’autres techniques ont été testées en France ces dernières années, parmi elles les radeaux à empreintes, l’ADN environnemental, les tunnels à crottes et enfin la capture. Celle-ci peut constituer une alternative à la détection de l’espèce, notamment sur les secteurs ou la recherche de fèces est inefficace à cause de variations hydrologiques, de la morphologie des sites ou du comportement de l’espèce, mais est aussi indispensable à certains protocoles tels que les suivis par radiopistage ou dans certains cas les CMR.

Time-lapse cameras facilitate remote and high-resolution monitoring of wild animal and plant communities, but the image data produced require further processing to be useful. Here we publish pipelines to process raw time-lapse imagery, resulting in count data (number of penguins per image) and ‘nearest neighbour distance’ measurements. The latter provide useful summaries of colony spatial structure (which can indicate phenological stage) and can be used to detect movement – metrics which could be valuable for a number of different monitoring scenarios, including image capture during aerial surveys. We present two alternative pathways for producing counts: (1) via the Zooniverse citizen science project Penguin Watch and (2) via a computer vision algorithm (Pengbot), and share a comparison of citizen science-, machine learning-, and expert- derived counts.

Cette étude vise à améliorer la connaissance de la mécanique migratoire de l’espèce sur la façade méditerranéenne afin de mieux la protéger.

We deploy camera traps to monitor feral cat (Felis catus) populations at two pastoral sites in Hawke’s Bay, North Island, New Zealand. At Site 1, cameras are deployed at pre-determined GPS points on a 500-m grid, and at Site 2, cameras are strategically deployed with a bias towards forest and forest margin habitat where possible. A portion of cameras are also deployed in open farmland habitat and mixed scrub. We then use the abundance-induced heterogeneity Royle–Nichols model to estimate mean animal abundance and detection probabilities for cameras in each habitat type. Model selection suggests that only cat abundance varies by habitat type. 

Dans un contexte de changement climatique et d’augmentation de la population, l’agriculture doit relever un défi majeur : produire plus et mieux tout en respectant l’environnement. L’agriculture de précision propose des technologies innovantes pour concilier performance agricole et respect de l’environnement.

Conservation translocations are an important tool in wildlife management, but monitoring of translocations has traditionally suffered from a lack of techniques for effective post‐release monitoring. Increasing understanding of post‐release movements is vital in improving the success of translocations, but few methods exist to efficiently monitor highly mobile and cryptic species post‐release.

We present a novel approach to using dynamic occupancy modelling in combination with data derived from autonomous acoustic recording units to monitor the post‐release behaviour of hihi (Notiomystis cincta), a threatened endemic bird, at a translocation site in New Zealand.