Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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Des poissons sous observation dans l'Atlantique Nord - Environnement Magazine

Des poissons sous observation dans l'Atlantique Nord - Environnement Magazine | Biodiversité | Scoop.it
Le projet européen NorTrack (North East Atlantic Marine Tracking Network) a été officiellement lancé en début d’année. D’une durée de trois ans, il vise à mieux connaître les mouvements des espèces marines afin de comprendre l’influence du changement climatique sur la faune et sa capacité d’adaptation.
DocBiodiv's insight:

Un projet de 1,6 million d'euros pour suivre les mouvements et la
répartition de la faune aquatique dans l'Atlantique Nord-Est. Communiqué de l'Ifremer le 22/03/2024. Suivre @AquaticTracking ; @BiodiversaPlus Voir aussi https:/www.europeantrackingnetwork.org/en/nortrack

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CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise

CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise | Biodiversité | Scoop.it
Le parc naturel marin d'Iroise accueille de nombreuses espèces de cétacés: dauphins communs, marsouins communs, rorquals communs, dauphins de Risso, globicéphales noirs, le parc et l'ENSTA Bretagne mettent en place un protocole d'écoute passive pour mieux connaitre toutes ces espèces sans les déranger.
DocBiodiv's insight:

Ecoutez https://soundcloud.com/ofbiodiversite/lecholocalisation-chez-le-grand-dauphin-tursiops-truncatus

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La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle

La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle | Biodiversité | Scoop.it

Face aux changements globaux actuels, l’enjeu des suivis de la dynamique de la biodiversité est croissant et entraîne une forte demande d’évaluations rapides et détaillées des changements de biodiversité. L’identification moléculaire des espèces est de plus en plus utilisée pour remplacer ou compléter les méthodes de surveillance écologique plus classiques. Le metabarcoding est considéré comme un outil d’inventaire, de connaissance de la biologie (prédateurs proies, pollinisateurs, etc.) et même de la découverte de l’histoire d’écosystèmes. Il permet de générer des données sur la biodiversité de manière rapide, précise et fiable, sur un large éventail d’organismes.

DocBiodiv's insight:

LE BORGNE H. & BOUGET C. 2024. — La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre. Naturae 2024 (3): 31-67. https://doi.org/10.5852/naturae2024a3

Bernadette Cassel's curator insight, February 20, 2:17 PM

 

Mots-clés :

Surveillance de la biodiversité, metabarcoding, ADN environnemental, biologie des espèces

 

 

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Sur les traces du Desman des Pyrénées

Sur les traces du Desman des Pyrénées | Biodiversité | Scoop.it

A cause des activités humaines qui ont modifié le milieu, fragmenté l’habitat et les populations de l’espèce (artificialisation des berges et des débits, construction de barrages hydroélectriques, pollutions...), l’aire de répartition du Desman des Pyrénées a diminué de plus de 50 % en 30 ans. Pour enrayer son déclin et mieux connaître cette espèce, un Plan national d’actions a vu le jour en 2021.

Fin septembre 2023, une opération de suivi du Desman des Pyrénées a été mise en œuvre au sein de la Réserve nationale de chasse et de faune sauvage d’Orlu afin de mieux comprendre cette mystérieuse espèce.

DocBiodiv's insight:

Voir aussi sir le site du Parc national des Pyrénées

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"Chaque jour, une vague scélérate se produit quelque part dans l'océan" : l'IA peut-elle nous aider à l'anticiper ?

"Chaque jour, une vague scélérate se produit quelque part dans l'océan" : l'IA peut-elle nous aider à l'anticiper ? | Biodiversité | Scoop.it

Au moins deux fois plus hautes que les vagues environnantes, les vagues scélérates peuvent endommager des navires et des conduits sous-marins. Des chercheurs de l'université de Copenhague ont utilisé l'intelligence artificielle (IA) pour analyser l'équivalent de 700 ans de données océaniques.

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Nastasia Michaels , le 21/11/2023nous donne le lien vers l'article scientifique Machine-guided discovery of a real-world rogue wave model Dion Häfner , Johannes Gemmrich Markus Jochum November 20, 2023, 120 (48) e2306275120 https://doi.org/10.1073/pnas.2306275120
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On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys

On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys | Biodiversité | Scoop.it

Abstract: Designing a large-scale multispecies survey presents significant challenges due to its multivariate, multiscale, and often multiobjective nature. Because it is impractical to measure or observe all variables of interest at every location in the survey area, spatial sampling is crucial. To ensure a statistically sound survey, free of assumptions, randomization of the selection of spatial sampling units is required. In a large-scale survey, minimizing travel costs requires multistage sampling in which nearby sampling units are grouped within higher-level sampling units.

DocBiodiv's insight:

Philippe Aubry, Gwenaël Quaintenne, Jeremy Dupuy, Charlotte Francesiaz, Matthieu Guillemain, Alain Caizergues, Ecological Informatics,Volume 77,2023, https://doi.org/10.101/j.ecoinf.2023.102229 via @C_Francesiaz

Article en lien avec l’enquête Limat qui a pour but d’estimer les effectifs nicheurs des différentes espèces d’anatidés et de limicoles sur le territoire métropolitain https://professionnels.ofb.fr/fr/node/1336 via @GSouchay

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Les capteurs de la qualité de l’air, alliés inattendus de la biodiversité - Courrier international

Les capteurs de la qualité de l’air, alliés inattendus de la biodiversité - Courrier international | Biodiversité | Scoop.it

Des appareils de surveillance de la pollution atmosphérique remplissent une seconde fonction, jusqu’ici inconnue, mais cruciale dans les efforts pour sauver la biodiversité mondiale, indique une nouvelle étude : la récupération de fragments d’ADN.

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Article de recherche : Air-quality networks collect environmental DNA with the potential to measure biodiversity at continental scales. Joanne E. Littlefair & al. Current Biology, Volume 33, ISSUE 11, PR426-R428, June 05, 2023 https://doi.org/10.1016/j.cub.2023.04.036

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Machine learning unravels controls on river water temperature regime dynamics - Journal of Hydrology

Water temperature is vitally important to the health of rivers and streams, influencing the integrity of ecosystems, aquatic biogeochemistry, and the habitability of waterways for a variety of species.

DocBiodiv's insight:

via @JeffWadeHydro "Our paper is out in Journal of Hydrology! An exciting collaboration with @hydrochrista and @freshwaterflows To untangle the complex controls of river thermal regimes, we trained random forest models to predict river water temperatures across the CONUS."

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Désextinction des espèces : le réveil du dodo

Désextinction des espèces : le réveil du dodo | Biodiversité | Scoop.it
L’entreprise Colossal Biosciences a annoncé, fin janvier 2023, travailler sur la résurrection du dodo. Un projet ambitieux qui joue avec les limites de la science-fiction. Avant de se demander s’il faut "déséteindre" certaines espèces, est-ce d’abord possible ?
DocBiodiv's insight:

Ce mercredi 1er mars 2023 à 16h avec Lionel Cavin Paléoichtyologue et Nadir Alvarez Biologiste de l’évolution, généticien, professeur à l'Université de Genève, et directeur du Muséum des Sciences Naturelles du canton de Vaud @ScienceCQFD @NatachaTriou @lionel_cavin

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Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien

Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien | Biodiversité | Scoop.it

Les baleines à bosse (Megaptera novaeangliae) de l'hémisphère sud migrent chaque année depuis les zones d'alimentation de l'Antarctique vers les zones tropicales où elles se rassemblent pour s'accoupler et mettre bas. Leurs cycles migratoires font l'objet de beaucoup d'intérêt et des suivis satellitaires ont été entrepris en différents points du globe. Si ces routes sont désormais mieux connues, des zones d'ombre demeurent notamment au sud de l'océan Indien.

DocBiodiv's insight:

Dans le cadre du programme MIROMEN, 11 baleines ont été équipées de balise GPS.

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Des chercheurs produisent une carte mondiale de la biodiversité végétale

Des chercheurs produisent une carte mondiale de la biodiversité végétale | Biodiversité | Scoop.it

Comment les espèces de plantes sont-elles réparties sur notre planète ? Il est désormais possible de le visualiser, grâce à la création d'une "carte mondiale de la diversité végétale" par une équipe internationale, dirigée par des chercheurs de l'Université de Göttingen (Allemagne). Dans un communiqué publié le 15 novembre 2022, ils présentent en effet leurs prédictions sur l'emplacement et le nombre de spécimens à travers le globe. Une initiative qui devrait "[soutenir] les efforts de conservation, [aider] à protéger la diversité végétale et [évaluer] les changements à la lumière des crises actuelles de la biodiversité et du climat", écrivent-ils.


Via Hubert MESSMER
DocBiodiv's insight:

Cai, L., Kreft, H., Taylor, A., Denelle, P., Schrader, J., Essl, F., van Kleunen, M., Pergl, J., Pyšek, P., Stein & al. (2022), Global models and predictions of plant diversity based on advanced machine learning techniques. New Phytol. https://doi.org/10.1111/nph.18533

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More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction - Communications Biology

More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction - Communications Biology | Biodiversité | Scoop.it

The IUCN Red List of Threatened Species is essential for practical and theoretical efforts to protect biodiversity. However, species classified as “Data Deficient” (DD) regularly mislead practitioners due to their uncertain extinction risk. Here we present machine learning-derived probabilities of being threatened by extinction for 7699 DD species, comprising 17% of the entire IUCN spatial datasets. Our predictions suggest that DD species as a group may in fact be more threatened than data-sufficient species. We found that 85% of DD amphibians are likely to be threatened by extinction, as well as more than half of DD species in many other taxonomic groups, such as mammals and reptiles.

DocBiodiv's insight:

Borgelt, J., Dorber, M., Høiberg, M.A. et al. More than half of data deficient species predicted to be threatened by extinction. Commun Biol 5, 679 (2022). https://doi.org/10.1038/s42003-022-03638-9

via @Shoal_Org @david_tickner @CommsBio

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Une IA, juge de beauté des poissons tropicaux

Une IA, juge de beauté des poissons tropicaux | Biodiversité | Scoop.it
Des chercheurs ont entraîné une intelligence artificielle (IA) afin d’attribuer un score esthétique à 2400 espèces de poissons de récifs coralliens ou rocheux. Résultat : les poissons que nous jugeons les « moins beaux » sont ceux qui présentent, collectivement, la plus grande variété de caractéristiques écologiques et ont la plus longue histoire évolutive. Ce sont aussi les plus menacés…
DocBiodiv's insight:

"Un « délit de sale gueule » jusque chez les scientifiques ?", bonne question ! via @AlainSchuhl

Langlois J, Guilhaumon F, Baletaud F, Casajus N, De Almeida Braga C, Fleuré V, et al. (2022) The aesthetic value of reef fishes is globally mismatched to their conservation priorities. PLoS Biol 20(6): e3001640. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001640

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Les drones déjouent les obstacles pour mesurer la biodiversité dans les zones reculées

Les drones déjouent les obstacles pour mesurer la biodiversité dans les zones reculées | Biodiversité | Scoop.it

Le suivi environnemental est un défi dans les zones où la végétation dense limite la collecte de données. Une équipe de scientifiques de l'Institut fédéral suisse de recherches sur la forêt, la neige et le paysage WSL, de l'ETH Zurich et de l'Université de Pise a construit un drone capable de se faufiler à travers le feuillage, comme le font les animaux. Il s'agit d'une étape essentielle pour évaluer la biodiversité dans les zones reculées.

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03.04.2024 par Fabienne Frey @WSL_research

Article : Aucone, E., Geckeler, C., Morra, D. et al. Synergistic morphology and feedback control for traversal of unknown compliant obstacles with aerial robots. Nat Commun 15, 2646 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-46967-5

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A scalable and transferable approach to combining emerging conservation technologies to identify biodiversity change after large disturbances

Ecological disturbances are becoming more extensive and intensive globally, a trend exemplified by ‘megafires’ and industrial deforestation, which cause widespread losses of forest cover. Yet the hypothesis that contemporary environmental disturbances are affecting biodiversity has been difficult to test directly.

DocBiodiv's insight:
Wood, C. M., Socolar, J., Kahl, S., Peery, M. Z., Chaon, P., Kelly, K., Koch, R. A., Sawyer, S. C., & Klinck, H. (2024). Journal of Applied Ecology, 00, 111. https://doi.org/10.1111/1365-2664.14579
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Les technologies du Big Data révèlent comment les animaux survivent dans un monde en évolution -

Les technologies du Big Data révèlent comment les animaux survivent dans un monde en évolution - | Biodiversité | Scoop.it

Des approches modernes du suivi et de la surveillance des animaux sont possibles grâce au développement de technologies qui génèrent de vastes ensembles de données à haute résolution. Ces technologies, ainsi que les progrès des méthodes analytiques, permettent aux biologistes de suivre les mouvements des mammifères, des oiseaux et des poissons en liberté à des échelles sans précédent.

DocBiodiv's insight:

Voir sur le site du Centre Minerva pour l’écologie du mouvement où le " système de GPS inversé, appelé ATLAS, a été développé notamment par le professeur Sivan Toledo de l’Université de Tel Aviv et les équipes". Voir aussi le site du Journal Movement Ecology

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Ce que l'on sait du "sol électronique", qui fait croître les plantes 50 % plus rapidement

Ce que l'on sait du "sol électronique", qui fait croître les plantes 50 % plus rapidement | Biodiversité | Scoop.it

Face à l'augmentation des besoins alimentaires et à l'érosion des surfaces agricoles, les cultures "hors-sol" se développent. Des chercheurs ont récemment réussi à améliorer le rendement des plantes grâce à une technique basée sur la stimulation électrique des racines. 

DocBiodiv's insight:

eSoil: A low-power bioelectronic growth scaffold that enhances crop seedling growth Vasileios K. Oikonomou,Miriam Huerta, Alexandra Sandéhn and Eleni Stavrinidou Stanford University, December 26, 2023 121 (2) e2304135120 https://doi.org/10.107/pnas.2304135120

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Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France

Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France | Biodiversité | Scoop.it

We illustrate how to build spaces of interactions between research and management. We present two case studies we conducted through a long-term collaboration between the Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE; academic/science—a public research laboratory mostly focused on basic ecological questions) and the French Biodiversity Agency (OFB; non-academic/management—a public institute dedicated to biodiversity protection and restauration, under administrative supervision of ecology and agriculture ministries) with biodiversity monitoring in national parks and management of large carnivores in France.

DocBiodiv's insight:

Thibaut CouturierSarah BauduinGuillelme Astruc, & al.05 June 2023, Ecological Solutions and Evidence, Vol.4 https://doi.org/10.1002/2688-8319.12245

Lire aussi "L’OFB et le CNRS bâtissent des ponts entre recherche en écologie et conservation de la biodiversité"

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Podacst - Intelligence artificielle bonne ou mauvaise idée pour la planète ? La Terre au carré - 12/04/2023

Podacst - Intelligence artificielle bonne ou mauvaise idée pour la planète ? La Terre au carré - 12/04/2023 | Biodiversité | Scoop.it
Grâce à ses algorithmes de machine learning, l'intelligence artificielle permet d'améliorer la modélisation climatique et de développer des projections très utiles pour l'écologie. Mais en parallèle, l’impact énergétique de ces outils d’intelligence artificielle grossit à un rythme exponentiel.
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Avec Philippe Ciais chercheur CEA au Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement (LSCE-IPSL). Julie Deshayes, océanographe climat au CNRS affectée au laboratoire LOCEAN. Jacques Sainte-Marie chercheur à l’INRIA et à Sorbonne Université en charge des questions liant numérique et environnement

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Programme d’études Colombidés - Bilans annuels

Programme d’études Colombidés - Bilans annuels | Biodiversité | Scoop.it
Ces documents présentent le bilan du suivi des Colombidés mené depuis 2019 au niveau national dans le cadre du programme d'étude dédié à 4 espèces : campagne de baguage et recaptures d’oiseaux bagués, suivi de la reproduction. Les résultats sont mis en perspective avec ceux des années précédentes. D'autres études plus spécifiques liées au programme sont aussi présentées, telles que le suivi des déplacements par voie satellitaire, les analyses isotopiques ou les études des tableaux de chasse.
DocBiodiv's insight:

Auteur Hervé Lormée, OFB, mai 2023

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L’océan, un monde à découvrir - Journal du CNRS

L’océan, un monde à découvrir - Journal du CNRS | Biodiversité | Scoop.it
À l'occasion de la Journée mondiale de l'océan, le 8 juin, plongez dans les recherches océaniques aux côtés des scientifiques. Que sait-on vraiment des océans et de leurs évolutions actuelles ? Que nous apprennent-ils de l’histoire de la Terre et de l’apparition de la vie ? Quelle influence ont-ils sur le climat ? Quelles espèces y trouve-t-on ? Comment lutter contre l’importante pollution causée par nos déchets plastiques ? Éléments de réponse grâce à cette sélection d’articles, diaporamas et vidéos.
DocBiodiv's insight:

Dernier article du dossier : Les grands fonds marins : ces inconnus menacés 05.06.2023, par Sebastián Escalón

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Anthropocène, l'âge des humains

Anthropocène, l'âge des humains | Biodiversité | Scoop.it
L’Anthropocène est une nouvelle époque géologique qui se caractérise par l’avènement des hommes comme principale force de changement sur Terre, surpassant les forces géophysiques. C’est l’âge des humains, celui d’un désordre planétaire inédit.
DocBiodiv's insight:

Intéressante synthèse en début sur le concept d'anthropocène et sa genèse. que l'on peut aussi écouter ds la chronique de @cy_lacarriere

D'où ça sort ? "L'anthropocène" Ce replay de l'émission Zoom Zoom Zen du 8/02/2023 est à compléter par celui-ci Le technosolutionnisme, remède pour la sauvegarde de notre planète ?

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Télédétection des infrastructures agro-écologiques : retour sur le projet Tel-IAE - Sciences Eaux & Territoires

Télédétection des infrastructures agro-écologiques : retour sur le projet Tel-IAE	- Sciences Eaux & Territoires | Biodiversité | Scoop.it
Cartographier les infrastructures agroécologiques est une étape importante pour évaluer la qualité des paysages agricoles et prédire l’impact des aménagements. La télédétection spatiale présente d’importants atouts pour atteindre cet objectif à coût raisonnable et sur une surface importante.
DocBiodiv's insight:

SAUSSE, C., & SHEEREN, D. (2022). . https://doi.org/10.20870/Revue-SET.2022.40.7175

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L’évolution des mammifères a ralenti au cours des 66 derniers millions d’années

L’évolution des mammifères a ralenti au cours des 66 derniers millions d’années | Biodiversité | Scoop.it

Une équipe internationale vient de publier dans la revue Science une étude sur l’évolution de la morphologie crânienne chez les mammifères sur une période qui s’étend de l’époque des dinosaures à nos jours. À partir d’approches phylogénétiques et de scanners 3D sur 322 espèces représentant les principales familles actuelles ainsi que les principaux ordres fossiles, l’étude montre que les taux d’évolution phénotypiques se sont d’abord intensifiés au début de la diversification des mammifères, probablement en lien avec l’extinction concomitante des dinosaures, mais n’ont par la suite cessé de diminuer.

DocBiodiv's insight:

Goswami, A., Noirault, E., Coombs, E.J, Clavel, J., Fabre, A.C &al. R.N. 2022. Attenuated evolution of mammals through the Cenozoic. Science via @INEE_CNRS @anjgoswami

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Premiers résultats pour la campagne de recensement de la mégafaune marine en Atlantique nord-est SCANS-IV

Premiers résultats pour la campagne de recensement de la mégafaune marine en Atlantique nord-est SCANS-IV | Biodiversité | Scoop.it

Sur près de 15 000 kilomètres parcourus, plus de 1000 observations de mammifères marins ont été effectuées. Depuis 1994, les campagnes SCANS (Small Cetaceans in European Atlantic waters and the North Sea) ont pour objectifs d’évaluer l’abondance et la répartition des mammifères marins, mais aussi des oiseaux, tortues, grands poissons et déchets en mer. Elles sont réalisées tous les six ans pour évaluer l’état écologique de ces populations.

DocBiodiv's insight:

En savoir plus, carnet de bord de la campagne https://storymaps.arcgis.com/stories/90250af8d1ff48be9a8a40ec63a8476c

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