Biodiversité
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Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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Connaissances : les poissons et crustacés d’eau douce de Guadeloupe inventoriés et cartographiés grâce à la méthode d’ADN environnemental, une première ! Pôle-relais Zones Humides Tropicales

Connaissances : les poissons et crustacés d’eau douce de Guadeloupe inventoriés et cartographiés grâce à la méthode d’ADN environnemental, une première ! Pôle-relais Zones Humides Tropicales | Biodiversité | Scoop.it

La Liste Rouge des espèces menacées requiert des données suffisamment précises sur les espèces à évaluer afin d’obtenir un résultat robuste. C’est dans cette optique que le Pôle-relais zones humides tropicales s’est associé à Sentinelle Lab, spécialiste des espèces d’eau douce de Guadeloupe, afin de poursuivre les efforts d’acquisition de connaissances sur les poissons et crustacés du territoire.

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Rapport final de l’étude (sept 2023) et Atlas cartographique de la répartition de l’ichtyofaune et de la carcinofaune dulçaquicoles de la Guadeloupe (2005 à 2022) disponibles sur cette page

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A quantitative eDNA-based approach to monitor fish spawning in lakes: Application to European perch and whitefish

A quantitative eDNA-based approach to monitor fish spawning in lakes: Application to European perch and whitefish | Biodiversité | Scoop.it

There is an urgent need to evaluate the effects of anthropogenic pressures and climatic change on fish populations’ dynamics. When monitored in lakes, fish spawning is generally assessed using traditional, mostly destructive or damaging, methods as gillnetting and collection of fertilized eggs. Over the last decade, environmental DNA (eDNA) based methods have been widely developed and now offer a non-invasive alternative method to these traditional biomonitoring tools.

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Marine Vautier, Cécile Chardon, Chloé Goulon, Jean Guillard, Isabelle Domaizon, Fisheries Research,Volume 264,2023 https://doi.org/10.1016/j.fishres.2023.106708.

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Alose feinte de Méditerranée : une migration encore méconnue

Alose feinte de Méditerranée : une migration encore méconnue | Biodiversité | Scoop.it
Certains animaux sont amenés à migrer pour effectuer une partie de leur cycle de vie. Ces migrations sont parfois bien visibles, comme c’est le cas par exemple des grands rassemblements d’hirondelles avant leur départ vers des pays plus chauds. Mais il existe une migration plus discrète, et tout aussi spectaculaire, qui se déroule chaque année dans des rivières du Gard : celle de l’Alose feinte de Méditerranée (Alosa agone). L’Office français de la biodiversité (OFB) est l’un des acteurs qui veille au bon déroulement de ce phénomène sur le territoire.
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Voir aussi : Les poissons migrateurs ou amphihalins et la restauration des cours d’eau https://professionnels.ofb.fr/node/175

et le rapport Aloses feintes en Corse. Recherche de présence grâce à l'ADN environnemental. Rapport final décembre 2019

 

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Le génome d'un poisson «ancien» séquencé - INRAE INSTIT

Le génome d'un poisson «ancien» séquencé - INRAE INSTIT | Biodiversité | Scoop.it
Le séquençage du génome du Sterlet, petit esturgeon d’Europe, a permis de mettre en évidence un mécanisme original de l’évolution du génome. Ce séquençage permet également de franchir une étape importante dans la gestion des populations d’élevage.
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Référence : Du, K., Stöck, M., Kneitz, S. et al. The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization. Nat Ecol Evol (2020). https://doi.org/10.1038/s41559-020-1166-x
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Filet de pêche ou éprouvette ?

Filet de pêche ou éprouvette ? | Biodiversité | Scoop.it
Parce qu’il est impossible de compter rigoureusement le nombre d’espèces ou d’individus d’insectes d’un jardin par exemple ou de poissons d’une crique, les scientifiques qui étudient la biodiversit…
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Référence : Cilleros K et Al. (2018) Unlocking biodiversity and conservation studies in high-diversity environments using environmental DNA (eDNA): A test with Guianese freshwater fishes. Mol Ecol Resour. 2018 May 16.

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A Splash of River Water Now Reveals the DNA of All Its Creatures

A Splash of River Water Now Reveals the DNA of All Its Creatures | Biodiversité | Scoop.it
Quick and inexpensive DNA sampling of a river, stream, or lake can now divulge what fish or other animals live there. This rapidly growing environmental DNA, or eDNA, technology is proving to be a game-changing conservation tool.
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Quand les poissons souffrent des canicules marines à répétition - Reportage

Quand les poissons souffrent des canicules marines à répétition - Reportage | Biodiversité | Scoop.it

La Méditerranée est en surchauffe et ce n'est pas sans effet sur la biodiversité. Lorsque l'eau est plus chaude, les poissons montrent des signes de faiblesse.

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2 minutes avec les chercheurs sur la plage de Frontignan, dans l'Hérault, de Célia Quilleret.

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Le paléoenvironnement, les conditions environnementales mais aussi les activités humaines structurent la biodiversité des poissons d’eau douce de Guyane

Le paléoenvironnement, les conditions environnementales mais aussi les activités humaines structurent la biodiversité des poissons d’eau douce de Guyane | Biodiversité | Scoop.it

La Guyane présente un réseau hydrographique dense avec sept bassins versants majeurs qui abritent plus de 400 espèces de poissons, et représente près de 76 % de la faune piscicole d’eau douce française. Ce territoire qui occupe 1 % de la surface de la région amazonienne est également le mieux préservé et couvert à plus de 90 % de forêt équatoriale. La Guyane est soumise à une forte croissante démographique (2.5 % / an) qui s’accompagne d’une hausse des activités humaines.

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Coutant, O., Jézéquel, C., Mokany, K., Cantera, I., Covain, R., Valentini, A., Dejean, T., Brosse, S.*, & Murienne, J.* (2022). Environmental DNA reveals a mismatch between diversity facets of Amazonian fishes in response to contrasting geographical, environmental and anthropogenic effects. Global Change Biology, 00, 1‑18. https://doi.org/10.1111/gcb.16533. (* Contribution équivalente)

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Lignées isogéniques de truite arc-en-ciel, outil biologique remarquable pour étudier les interactions génétique x épigénétique x environnement

Lignées isogéniques de truite arc-en-ciel, outil biologique remarquable pour étudier les interactions génétique x épigénétique x environnement | Biodiversité | Scoop.it

Des mécanismes épigénétiques (e.g. méthylation de l'ADN, modification des histones) peuvent être impliqués dans la persistance à long-terme d'effets physiologiques résultant d'événements survenus dans la vie d'un animal. Ces mécanismes sont mis en jeu dans la réponse d'un organisme à des changements d’environnement et les jeunes stades de vie (embryons, larves pour les poissons) y sont particulièrement sensibles. Dans une étude parue dans Epigenetics, les chercheurs de Unité de Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont essayé de comprendre comment différents génotypes mettent en place différents mécanismes épigénétiques en réponse à un stimulus environnemental et ainsi modulent leur phénotype.


Via Life Sciences UPSaclay
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La survie des poissons clowns dépend plus de l’environnement que de la génétique | CNRS

La survie des poissons clowns dépend plus de l’environnement que de la génétique | CNRS | Biodiversité | Scoop.it
Les poissons clowns n’ont pas la capacité génétique de s’adapter aux modifications de leur environnement. C’est ce que viennent de démontrer des scientifiques du CNRS1 et leurs collègues australiens, saoudiens, chiliens et américains dans une étude, sans précédent pour le milieu sous-marin, à paraitre le 26 novembre 2019 dans Ecology Letters.
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Strong habitat and weak genetic effects shape the lifetime reproductive success in a wild clownfish population. Océane C. Salles, Glenn R. Almany, Michael L. Berumen, Geoffrey P. Jones, Pablo Saenz-Agudelo, Maya Srinivasan, Simon R. Thorrold, Benoit Pujol, and Serge Planes; Ecology Letters, In Press (2019).

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Des scientifiques découvrent comment détecter des « requins cachés »

Des scientifiques découvrent comment détecter des « requins cachés » | Biodiversité | Scoop.it

Il est impossible de localiser chaque requin dans la mer. Mais nous pouvons détecter leur « ADN environnemental ».

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Auteurs : Stefano Mariani , Chair in Conservation Genetics, University of Salford et Judith Bakker  , Research Fellow, Environment & Life Sciences, University of Salford

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L'ADN laissé par les poissons dans l'eau utilisé pour analyser leurs mouvements

L'ADN laissé par les poissons dans l'eau utilisé pour analyser leurs mouvements | Biodiversité | Scoop.it
Une simple analyse de l'ADN laissé par les poissons dans l'eau a permis de traquer la présence ou l'absence d'espèces lors d'une migration saisonnière.
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Retrouvez l'article scientifique : PLOS ONE, online: April 12, 2017 Aquatic Environmental DNA Detects Seasonal Fish Abundance and Habitat Preference in an Urban Estuary Mark Y. Stoeckle, Lyubov Soboleva, and Zachary Charlop-Powers
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