Biodiversité
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Biodiversité
Revue de presse et du net par le Pôle de partage des connaissances S&T de l'Office français de la biodiversité
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Des poissons sous observation dans l'Atlantique Nord - Environnement Magazine

Des poissons sous observation dans l'Atlantique Nord - Environnement Magazine | Biodiversité | Scoop.it
Le projet européen NorTrack (North East Atlantic Marine Tracking Network) a été officiellement lancé en début d’année. D’une durée de trois ans, il vise à mieux connaître les mouvements des espèces marines afin de comprendre l’influence du changement climatique sur la faune et sa capacité d’adaptation.
DocBiodiv's insight:

Un projet de 1,6 million d'euros pour suivre les mouvements et la
répartition de la faune aquatique dans l'Atlantique Nord-Est. Communiqué de l'Ifremer le 22/03/2024. Suivre @AquaticTracking ; @BiodiversaPlus Voir aussi https:/www.europeantrackingnetwork.org/en/nortrack

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La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle

La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre - Publications scientifiques du Muséum national d'Histoire naturelle | Biodiversité | Scoop.it

Face aux changements globaux actuels, l’enjeu des suivis de la dynamique de la biodiversité est croissant et entraîne une forte demande d’évaluations rapides et détaillées des changements de biodiversité. L’identification moléculaire des espèces est de plus en plus utilisée pour remplacer ou compléter les méthodes de surveillance écologique plus classiques. Le metabarcoding est considéré comme un outil d’inventaire, de connaissance de la biologie (prédateurs proies, pollinisateurs, etc.) et même de la découverte de l’histoire d’écosystèmes. Il permet de générer des données sur la biodiversité de manière rapide, précise et fiable, sur un large éventail d’organismes.

DocBiodiv's insight:

LE BORGNE H. & BOUGET C. 2024. — La reconnaissance des espèces basée sur l’ADN : applications, perspectives et défis en milieu continental terrestre. Naturae 2024 (3): 31-67. https://doi.org/10.5852/naturae2024a3

Bernadette Cassel's curator insight, February 20, 2:17 PM

 

Mots-clés :

Surveillance de la biodiversité, metabarcoding, ADN environnemental, biologie des espèces

 

 

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Sur les traces du Desman des Pyrénées

Sur les traces du Desman des Pyrénées | Biodiversité | Scoop.it

A cause des activités humaines qui ont modifié le milieu, fragmenté l’habitat et les populations de l’espèce (artificialisation des berges et des débits, construction de barrages hydroélectriques, pollutions...), l’aire de répartition du Desman des Pyrénées a diminué de plus de 50 % en 30 ans. Pour enrayer son déclin et mieux connaître cette espèce, un Plan national d’actions a vu le jour en 2021.

Fin septembre 2023, une opération de suivi du Desman des Pyrénées a été mise en œuvre au sein de la Réserve nationale de chasse et de faune sauvage d’Orlu afin de mieux comprendre cette mystérieuse espèce.

DocBiodiv's insight:

Voir aussi sir le site du Parc national des Pyrénées

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On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys

On using stratified two-stage sampling for large-scale multispecies surveys | Biodiversité | Scoop.it

Abstract: Designing a large-scale multispecies survey presents significant challenges due to its multivariate, multiscale, and often multiobjective nature. Because it is impractical to measure or observe all variables of interest at every location in the survey area, spatial sampling is crucial. To ensure a statistically sound survey, free of assumptions, randomization of the selection of spatial sampling units is required. In a large-scale survey, minimizing travel costs requires multistage sampling in which nearby sampling units are grouped within higher-level sampling units.

DocBiodiv's insight:

Philippe Aubry, Gwenaël Quaintenne, Jeremy Dupuy, Charlotte Francesiaz, Matthieu Guillemain, Alain Caizergues, Ecological Informatics,Volume 77,2023, https://doi.org/10.101/j.ecoinf.2023.102229 via @C_Francesiaz

Article en lien avec l’enquête Limat qui a pour but d’estimer les effectifs nicheurs des différentes espèces d’anatidés et de limicoles sur le territoire métropolitain https://professionnels.ofb.fr/fr/node/1336 via @GSouchay

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L’évolution des mammifères a ralenti au cours des 66 derniers millions d’années

L’évolution des mammifères a ralenti au cours des 66 derniers millions d’années | Biodiversité | Scoop.it

Une équipe internationale vient de publier dans la revue Science une étude sur l’évolution de la morphologie crânienne chez les mammifères sur une période qui s’étend de l’époque des dinosaures à nos jours. À partir d’approches phylogénétiques et de scanners 3D sur 322 espèces représentant les principales familles actuelles ainsi que les principaux ordres fossiles, l’étude montre que les taux d’évolution phénotypiques se sont d’abord intensifiés au début de la diversification des mammifères, probablement en lien avec l’extinction concomitante des dinosaures, mais n’ont par la suite cessé de diminuer.

DocBiodiv's insight:

Goswami, A., Noirault, E., Coombs, E.J, Clavel, J., Fabre, A.C &al. R.N. 2022. Attenuated evolution of mammals through the Cenozoic. Science via @INEE_CNRS @anjgoswami

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Rescooped by DocBiodiv from La revue de web ornithologique de la LPO Île-de-France
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Pyrénées : Balises GPS, chemins à éviter… Comment faire cohabiter l’emblématique grand tétras et les touristes ?

Pyrénées : Balises GPS, chemins à éviter… Comment faire cohabiter l’emblématique grand tétras et les touristes ? | Biodiversité | Scoop.it
"A Superbagnères, dans la Haute-Garonne, des grands tétras, ces coqs de bruyère rares et emblématiques, sont désormais équipés de balises GPS. L’objectif est de les connaître mieux pour les déranger moins"

Via LPO Île-de-France
DocBiodiv's insight:

A noter "Avec 20,9% de fréquentation en plus cette année, les Pyrénées passent en tête des destinations montagne préférées des Français. " dans la Semaine des Pyrénées, Patrick Sacristan le 9/09/2021 https://www.lasemainedespyrenees.fr/2021/09/09/bigorre-bilan-tres-positif-pour-les-domaines-npy-et-ses-grands-sites/ via @ClusterMontagne

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Les caméras thermiques militaires révolutionnent l'observation et la connaissance du loup

Les caméras thermiques militaires révolutionnent l'observation et la connaissance du loup | Biodiversité | Scoop.it
Pour mieux protéger les troupeaux, un éthologue a entrepris de mieux identifier et comprendre le comportement des loups. Avec des caméras thermiques mises au point par Thalès, il a observé des milliers d'heures l'animal. Ce qu'il met en évidence révolutionne la connaissance du loup et de ses comportements.
DocBiodiv's insight:

France Inter par Sophie Bécherel publié le 26 juillet 2021 qui nous donne le lien vers le site de l'IPRA (Institut pour la Promotion et la Recherche sur les Animaux de protection) créé en 1997 par Jean-Marc Landry, biologiste et éthologue https://www.ipra-landry.com/

Voir aussi : https://www.loupfrance.fr/suivi-du-loup/situation-du-loup-en-france/

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Desman des Pyrénées (Galemys pyrenaicus É. Geoffroy Saint-Hilaire, 1811) 2011-2018 : bilan et retours d’expérience sur huit années de capture dans les Pyrénées françaises -

Desman des Pyrénées (Galemys pyrenaicus É. Geoffroy Saint-Hilaire, 1811) 2011-2018 : bilan et retours d’expérience sur huit années de capture dans les Pyrénées françaises - | Biodiversité | Scoop.it

À l’heure où la prise en compte du Desman des Pyrénées, Galemys pyrenaicus É. Geoffroy Saint-Hilaire, 1811 dans toutes les procédures environnementales devient la norme, il convient de proposer des protocoles efficaces pour permettre le suivi de l’espèce. Outre la recherche de fèces, d’autres techniques ont été testées en France ces dernières années, parmi elles les radeaux à empreintes, l’ADN environnemental, les tunnels à crottes et enfin la capture. Celle-ci peut constituer une alternative à la détection de l’espèce, notamment sur les secteurs ou la recherche de fèces est inefficace à cause de variations hydrologiques, de la morphologie des sites ou du comportement de l’espèce, mais est aussi indispensable à certains protocoles tels que les suivis par radiopistage ou dans certains cas les CMR.

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PONCET É., BLANC F., LIM M., MARC D. & NÉMOZ M. 2021. Naturae 2021 (3): 35-47.

Infos en plus sur : http://www.desman-life.fr

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Projets Annuels 2020 : interface science-société

Projets Annuels  2020 : interface science-société | Biodiversité | Scoop.it

ANOMALO : Analyses préliminaires à l’élaboration d’un Plan National d’Action pour les Anomaloglossus du groupe degranvillei

DARKSOUND : les sons des oiseaux de la pénombre tropicale : l’écoacoustique comme aide au diagnostic patrimonial et écologique

eBREVE : Education à la Biodiversité par la Réalité Virtuelle

INDIC : Proposition de «trousse d’indicateurs écosystémiques» à destination des espaces naturels forestiers de Guyane

IQCN: identifier la faune aquatique et Quantifier l’abondance des espèces en danger dans les cours d’eau de Guyane : des enjeux forts pour la Conservation de la Nature

KALALOU : ou le rapport à la biodiversité végétale dans les cultures Afro-américaines de Guyane

Ti Sciences M.A.G : le petit journal des sciencesmade in Amazonie et en Guyane en particulier, ou la biodiversité amazonienne expliquée aux 8-12 ans

DocBiodiv's insight:

"Le Laboratoire d’Excellence CEBA fédère un réseau d’équipes de recherche françaises internationalement reconnues étudiant la biodiversité en Amazonie. Il favorise une recherche de pointe sur la biodiversité en Guyane, encourage les collaborations avec les pays d’Amérique du Sud, insiste sur la nécessité de répercuter les résultats de recherche fondamentale à la société."

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[Accès lecture] Faune sauvage N°326 et Espaces naturels N°70 sont exceptionnellement disponibles en ligne

[Accès lecture] Faune sauvage N°326 et Espaces naturels N°70 sont exceptionnellement disponibles en ligne | Biodiversité | Scoop.it

Faune sauvage n°325 - Le bulletin technique et juridique de l’OFB

Les constantes évolutions technologiques nous offrent de nouveaux moyens d’investigation pour améliorer nos connaissances sur la faune sauvage, en vue de mieux la conserver et de mieux la gérer. Ce numéro en livre des exemples :

expérimentation du drone pour dénombrer des populations d’oiseaux, et dossier complet consacré au GPS

 

Espaces naturels n°70 - La revue des professionnels de la nature

Ce trimestre, le dossier central montre les liens entre global et local pour la protection de la biodiversité. En quoi sommes-nous concernés par les grandes négociations internationales ? Qu'apporte la coopération ? Comment travailler à l'international sur des espaces ou des espèces ? Analyses, discussions et témoignages éclairent le sujet.

DocBiodiv's insight:

Feuilletez Espaces Naturels N°70 pour retrouvez ses rubriques habituelles. Et notamment le focus sur les prérogatives renforcées de la police de l'environnement https://fr.calameo.com/ofbiodiversite/read/0035029484baf064d8c80?authid=TPJLEdIQhaPN

Feuilletez Faune sauvage N°325 pour retrouvez notamment l'article consacré au Réseau national Échouages : un outil d’évaluation et de surveillance des populations de mammifères marins https://fr.calameo.com/ofbiodiversite/read/003502948f0f00472a783?authid=7Db7WupkHq0w

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Traque efficace ?

Traque efficace ? | Biodiversité | Scoop.it
La technologie qui consiste à suivre les mouvements des animaux en les équipant de balises satellite tend à se développer pour répondre à des questions de recherche sur la faune sauvage. Si les équ…
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via @ComAuCarre

MPG Hofman et al. (2019) Right on track ? Performance of satellite telemetry in terrestrial wildlife research. PLoS One. 2019 May 9;14(5):e0216223.

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Doit-on remplacer des animaux en voie d’extinction par des robots ?

Doit-on remplacer des animaux en voie d’extinction par des robots ? | Biodiversité | Scoop.it
C’est l’un des enjeux étudiés par Robotica, un projet explorant les synergies possibles entre faune sauvage et faune technologique.
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Publié par Margaux Dussert le 21/11/2017 dans la revue L'ADN
Science-fiction ?
L'occasion d'écouter Hubert Reeves rappeler que la biodiversité c'est non seulement les espèces, mais les relations qu'elles ont entre elles... et là ? https://www.youtube.com/watch?v=Hu1DuVZuHf8
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CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise

CETIROISE - Programme d’acoustique passive des espèces. Parc naturel marin Iroise | Biodiversité | Scoop.it
Le parc naturel marin d'Iroise accueille de nombreuses espèces de cétacés: dauphins communs, marsouins communs, rorquals communs, dauphins de Risso, globicéphales noirs, le parc et l'ENSTA Bretagne mettent en place un protocole d'écoute passive pour mieux connaitre toutes ces espèces sans les déranger.
DocBiodiv's insight:

Ecoutez https://soundcloud.com/ofbiodiversite/lecholocalisation-chez-le-grand-dauphin-tursiops-truncatus

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L’anguille européenne, une mystérieuse migratrice face à tous les dangers - La Salamandre

L’anguille européenne, une mystérieuse migratrice face à tous les dangers - La Salamandre | Biodiversité | Scoop.it

[VOLET 1/2] La compréhension du cycle de vie des anguilles est digne d’un polar scientifique. Il fascine depuis des siècles, et pourtant l’espèce est en proie à bien des menaces anthropiques. Face aux constats alarmants, des scientifiques œuvrent à mieux la comprendre et la protéger.

DocBiodiv's insight:

Une enquête d'Hortense Chauvin (Reporterre) et Théo Tzelepoglou, partenariat avec Reporterre. Seconde partie : L’anguille française victime d’un vaste trafic international

Pour avoir une idée : 30 kg d’anguilles = 1 million d’euros

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Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France

Building spaces of interactions between researchers and managers: Case studies with wildlife monitoring and conservation in France | Biodiversité | Scoop.it

We illustrate how to build spaces of interactions between research and management. We present two case studies we conducted through a long-term collaboration between the Centre for Functional and Evolutionary Ecology (CEFE; academic/science—a public research laboratory mostly focused on basic ecological questions) and the French Biodiversity Agency (OFB; non-academic/management—a public institute dedicated to biodiversity protection and restauration, under administrative supervision of ecology and agriculture ministries) with biodiversity monitoring in national parks and management of large carnivores in France.

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Thibaut CouturierSarah BauduinGuillelme Astruc, & al.05 June 2023, Ecological Solutions and Evidence, Vol.4 https://doi.org/10.1002/2688-8319.12245

Lire aussi "L’OFB et le CNRS bâtissent des ponts entre recherche en écologie et conservation de la biodiversité"

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Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien

Le suivi des baleines à bosse dans l’océan Indien | Biodiversité | Scoop.it

Les baleines à bosse (Megaptera novaeangliae) de l'hémisphère sud migrent chaque année depuis les zones d'alimentation de l'Antarctique vers les zones tropicales où elles se rassemblent pour s'accoupler et mettre bas. Leurs cycles migratoires font l'objet de beaucoup d'intérêt et des suivis satellitaires ont été entrepris en différents points du globe. Si ces routes sont désormais mieux connues, des zones d'ombre demeurent notamment au sud de l'océan Indien.

DocBiodiv's insight:

Dans le cadre du programme MIROMEN, 11 baleines ont été équipées de balise GPS.

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Premiers résultats pour la campagne de recensement de la mégafaune marine en Atlantique nord-est SCANS-IV

Premiers résultats pour la campagne de recensement de la mégafaune marine en Atlantique nord-est SCANS-IV | Biodiversité | Scoop.it

Sur près de 15 000 kilomètres parcourus, plus de 1000 observations de mammifères marins ont été effectuées. Depuis 1994, les campagnes SCANS (Small Cetaceans in European Atlantic waters and the North Sea) ont pour objectifs d’évaluer l’abondance et la répartition des mammifères marins, mais aussi des oiseaux, tortues, grands poissons et déchets en mer. Elles sont réalisées tous les six ans pour évaluer l’état écologique de ces populations.

DocBiodiv's insight:

En savoir plus, carnet de bord de la campagne https://storymaps.arcgis.com/stories/90250af8d1ff48be9a8a40ec63a8476c

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Post-fledging movements, mortality and migration of juvenile northern gannets

Post-fledging movements, mortality and migration of juvenile northern gannets | Biodiversité | Scoop.it

Studying the at-sea movements and behaviour of juvenile seabirds is logistically challenging, but new technologies now allow tracking birds on their first migration, giving a more complete picture of population-level spatial ecology. We investigated the post-fledging migration of juvenile northern gannets Morus bassanus from the world's largest colony, at Bass Rock, Scotland. We first examined the movements and survival of 38 juveniles over their initial days at sea with GPS precision for up to 53 d post-fledging. We then compared their migration journeys with those of 35 adults tracked with geolocators.

DocBiodiv's insight:

via @heyjooode

Lane JV, Pollock CJ, Jeavons R, Sheddan M, Furness RW, Hamer KC (2021) Post-fledging movements, mortality and migration of juvenile northern gannets. Mar Ecol Prog Ser 671:207-218. https://doi.org/10.3354/meps13804  
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The Australian Acoustic Observatory - Roe - Methods in Ecology and Evolution

The Australian Acoustic Observatory - Roe - Methods in Ecology and Evolution | Biodiversité | Scoop.it

Acoustic recording has the potential to scale terrestrial fauna surveys in the same way that remote sensing drove the scaling of vegetation monitoring. To date, acoustic recording has been used to study and monitor individual species at selected sites, primarily threatened or invasive species...

DocBiodiv's insight:
Roe, P., Eichinski, P., Fuller, R. A., McDonald, P. G., Schwarzkopf, L., Towsey, M., Truskinger, A., Tucker, D., & Watson, D. M. (2021). The Australian Acoustic Observatory. Methods in Ecology and Evolution, 00, 17. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13660
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Rescooped by DocBiodiv from COVID-19 : Le Jour d'après et la biodiversité
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COVID19-induced reduction in human disturbance enhances fattening of an overabundant goose species - ScienceDirect

COVID19-induced reduction in human disturbance enhances fattening of an overabundant goose species - ScienceDirect | Biodiversité | Scoop.it

Abstract: Overabundant species can have major impacts on their habitat and induce trophic cascades within ecosystems. In North America, the overabundant greater snow goose (Anser caerulescens atlanticus) has been successfully controlled through special spring hunting regulations since 1999. Hunting is a source of mortality but also of disturbance, which affects the behavior and nutrient storage dynamics of staging snow geese. In 2020, the lockdown imposed by the COVID19 pandemic reduced hunting activity during their migratory stopover in Québec by at least 31%. This provided a unique opportunity to assess the effects of a sudden reduction in hunting disturbance on geese. We used long-term data on body mass combined with movement data from GPS-tracked birds in 2019 and 2020 to assess the effects of the 2020 lockdown on the spring body condition and behavior of greater snow geese.

DocBiodiv's insight:

Frédéric LeTourneux, Thierry Grandmont, Frédéric Dulude-de Broin, Marie-Claude Martin, Josée Lefebvre, Akiko Kato, Joël Bêty, Gilles Gauthier, Pierre Legagneux,. COVID19-induced reduction in human disturbance enhances fattening of an overabundant goose species, Biological Conservation, Volume 255, 2021, 108968, ISSN 0006-3207, https://doi.org/10.1016/j.biocon.2021.108968

DocBiodiv's curator insight, February 15, 2021 3:40 AM

Frédéric LeTourneux, Thierry Grandmont, Frédéric Dulude-de Broin, Marie-Claude Martin, Josée Lefebvre, Akiko Kato, Joël Bêty, Gilles Gauthier, Pierre Legagneux,. COVID19-induced reduction in human disturbance enhances fattening of an overabundant goose species, Biological Conservation, Volume 255, 2021, 108968, ISSN 0006-3207, https://doi.org/10.1016/j.biocon.2021.108968

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Retreat of large carnivores across the giant panda distribution range

Retreat of large carnivores across the giant panda distribution range | Biodiversité | Scoop.it

As both a flagship and umbrella species, the giant panda (Ailuropoda melanoleuca) is one of the most heavily invested species in conservation. Here, we report the wide distribution range retreat of the leopard (Panthera pardus, 81% loss), snow leopard (P. uncia, 38%), wolf (Canis lupus, 77%) and dhole (Cuon alpinus, 95%) from protected areas in the giant panda distribution range since the 1960s. The present findings indicate the insufficiency of giant panda conservation for protecting these large carnivore species and suggest that future conservation efforts should target restoring ecosystems with high trophic complexity to facilitate the recovery of large carnivore populations. Comparing historical records with contemporary camera trap surveys, the authors report widespread declines in the occurrence of four large carnivore species from protected areas within the distributional range of the giant panda.

DocBiodiv's insight:

Li, S., McShea, W.J., Wang, D. et al. Retreat of large carnivores across the giant panda distribution range. Nat Ecol Evol (2020). https://doi.org/10.1038/s41559-020-1260-0

via @NatureEcoEvo

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Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics

Processing citizen science- and machine-annotated time-lapse imagery for biologically meaningful metrics | Biodiversité | Scoop.it

Time-lapse cameras facilitate remote and high-resolution monitoring of wild animal and plant communities, but the image data produced require further processing to be useful. Here we publish pipelines to process raw time-lapse imagery, resulting in count data (number of penguins per image) and ‘nearest neighbour distance’ measurements. The latter provide useful summaries of colony spatial structure (which can indicate phenological stage) and can be used to detect movement – metrics which could be valuable for a number of different monitoring scenarios, including image capture during aerial surveys. We present two alternative pathways for producing counts: (1) via the Zooniverse citizen science project Penguin Watch and (2) via a computer vision algorithm (Pengbot), and share a comparison of citizen science-, machine learning-, and expert- derived counts.

DocBiodiv's insight:

Un papier qui parle données, comptage par piège photographique, projet de science participative concernant des pingouins, technique et matériel, transfert de l'expérience dans d'autres scenarios de suivi et inventaire !

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Animal Recognition and Identification with Deep Convolutional Neural Networks for Automated Wildlife Monitoring

Efficient and reliable monitoring of wild animals in their natural habitats is essential to inform conservation and management decisions. Automatic covert cameras or "camera traps" are being an increasingly popular tool for wildlife monitoring due to their effectiveness and reliability in collecting data of wildlife unobtrusively, continuously and in large volume. However, processing such a large volume of images and videos captured from camera traps manually is extremely expensive, time-consuming and also monotonous. This presents a major obstacle to scientists and ecologists to monitor wildlife in an open environment. 

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Auteurs : Hung Nguyen  Sarah J. Maclagan  Tu Dinh Nguyen  Thin Nguyen  Paul Flemons  Kylie Andrews  Euan G. Ritchie 

Published in: Data Science and Advanced Analytics (DSAA), 2017 IEEE International Conference 19-21 Oct. 2017 et en ligne en janv 2018
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