SCIENCES DU VEGETAL

Résumé de la communication

Les plantes interagissent avec une communauté microbienne abondante, comprenant de multiples taxons. Ce microbiote inclut des microorganismes phytobénéfiques, susceptibles d’améliorer la croissance ou la santé du végétal. La prise en compte du rôle du microbiote est illustrée par les notions de second génome et d’holobionte, qui traduisent l’importance maintenant accordée aux partenaires microbiens de la plante. L’efficacité des interactions plante/microbiote est devenue un enjeu scientifique de tout premier plan, ainsi qu’un enjeu pratique s’agissant de l’optimisation de ces interactions pour améliorer les performances agronomiques des plantes cultivées. D’une part, cette optimisation doit prendre en compte la biogéographie et les patrons de distribution des microorganismes, largement liés aux particularités pédoclimatiques et agronomiques. D’autre part, se pose la question des caractères génétiques de la plante impliqués dans le recrutement du microbiote, d’autant que la sélection variétale est typiquement réalisée sans prendre en compte explicitement le potentiel des effets symbiotiques microbiens. L’optimisation des propriétés génétiques de la plante représente un levier prometteur pour tirer un meilleur parti du microbiote dans le contexte actuel du changement global, avec la nécessité de diminuer les intrants en agriculture.

Les plantes hébergent une très grande diversité de virus et de micro-organismes ou microbiote (eubactéries, archées, champignons filamenteux, oomycètes, protistes) que l’on peut retrouver à l’intérieur ou à la surface des tissus de leurs différents organes : racines, feuilles, graines. Le résultat des interactions au sein du microbiote et entre le microbiote et la plante peut modifier le développement et l’adaptation à différentes contraintes abiotiques et biotiques du végétal. Ces observations questionnent sur (i) les processus écologiques impliqués dans l’assemblage des communautés microbiennes au voisinage et à l’intérieur des tissus de la plante, (ii) les espèces et les fonctions du microbiote impliquées dans les modifications phénotypiques de la plante en lien avec sa performance (croissance et santé) et (iii) le rôle du génotype de la plante dans l’amélioration ou le maintien des interactions bénéfiques qui contribuent à sa résistance et sa résilience aux bioagresseurs. Cette vision holistique de l’écosystème plante sera présentée et discutée durant le webinaire.